30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2428 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  153  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3971  hypothetical protein  85.71 
 
 		 77 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2985  hypothetical protein  80.52 
 
 		 77 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327676  normal  0.403692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2271  hypothetical protein  61.84 
 
 		 74 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0912556  hitchhiker  0.00147123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  46.77 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  48.15 
 
 		 63 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  51.85 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  51.85 
 
 		 63 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  51.85 
 
 		 63 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  51.85 
 
 		 63 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  43.14 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  46.3 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2250  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3524  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0647005  normal  0.531387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1461  hypothetical protein  55 
 
 		 58 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802957  normal  0.906352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2403  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.60813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  40.43 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  33.33 
 
 		 58 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  43.9 
 
 		 61 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2229  hypothetical protein  37.5 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36900  hypothetical protein  52.63 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.060023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1228  hypothetical protein  34.69 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.597283 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  45.1 
 
 		 63 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3511  hypothetical protein  41.51 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.573232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3633  hypothetical protein  37.25 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0717136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4546  hypothetical protein  31.82 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.195637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3172  hypothetical protein  50.88 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>