23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3971 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3971  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  85.71 
 
 		 77 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2985  hypothetical protein  93.51 
 
 		 77 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327676  normal  0.403692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2271  hypothetical protein  65.71 
 
 		 74 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0912556  hitchhiker  0.00147123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  46.77 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  48.39 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  44.44 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  46.77 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  46.77 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  46.77 
 
 		 63 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  47.06 
 
 		 64 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  44.23 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  44.23 
 
 		 67 aa  50.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  44.23 
 
 		 67 aa  47.8  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  42.55 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  40.32 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2250  hypothetical protein  35.71 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3524  hypothetical protein  35.71 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0647005  normal  0.531387 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  37.5 
 
 		 58 aa  42.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2403  hypothetical protein  33.93 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.60813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  43.14 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2229  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36900  hypothetical protein  52.63 
 
 		 71 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.060023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>