22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2985 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2985  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  150  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.327676  normal  0.403692 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3971  hypothetical protein  93.51 
 
 		 77 aa  144  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12122 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  80.52 
 
 		 77 aa  130  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2271  hypothetical protein  64.47 
 
 		 74 aa  92  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0912556  hitchhiker  0.00147123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  48.39 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  46.3 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  49.06 
 
 		 64 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  45.16 
 
 		 64 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  45 
 
 		 63 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  43.55 
 
 		 63 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  43.55 
 
 		 63 aa  52  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2919  hypothetical protein  46.15 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1259  hypothetical protein  46.15 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2624  hypothetical protein  38.98 
 
 		 64 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2697  hypothetical protein  42.31 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  44.44 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2250  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3524  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0647005  normal  0.531387 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2403  hypothetical protein  35.71 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.60813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2789  hypothetical protein  37.5 
 
 		 58 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.942989  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4546  hypothetical protein  33.33 
 
 		 79 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.195637  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3586  hypothetical protein  45.1 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>