16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2403 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3524  hypothetical protein  98.57 
 
 		 110 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0647005  normal  0.531387 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2250  hypothetical protein  98.57 
 
 		 110 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2403  hypothetical protein  100 
 
 		 70 aa  135  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.60813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2229  hypothetical protein  95.71 
 
 		 70 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476545  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23810  hypothetical protein  35.71 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2428  hypothetical protein  35.71 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0557927  normal  0.456948 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1446  hypothetical protein  38.46 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.10688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3971  hypothetical protein  33.93 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.12122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42710  hypothetical protein  34.62 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1837  hypothetical protein  38.98 
 
 		 63 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1982  hypothetical protein  37.78 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.525282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3873  hypothetical protein  38.98 
 
 		 63 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0534679  normal  0.0929101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1415  hypothetical protein  38.98 
 
 		 63 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.92548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3134  hypothetical protein  36.36 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.499641  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3848  hypothetical protein  35.85 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0790334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4546  hypothetical protein  32.26 
 
 		 79 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.195637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>