84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_1512 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1512  ubiquinone biosyntheis protein COQ7  100 
 
 
214 aa  442  1e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1691  putative ubiquinone biosyntheis protein COQ7  96.26 
 
 
214 aa  427  1e-119  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.150578  normal  0.801245 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0926  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  78.2 
 
 
213 aa  352  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222841  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0599  hypothetical protein  54.03 
 
 
215 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3941  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  52.13 
 
 
215 aa  228  6e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4574  hypothetical protein  53.08 
 
 
215 aa  227  1e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4776  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  51.18 
 
 
215 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.564721 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0427  hypothetical protein  52.13 
 
 
215 aa  225  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0457  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  51.18 
 
 
215 aa  223  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.314163 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0460  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  51.66 
 
 
215 aa  222  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  0.0120401 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46070  Ubiquinone biosynthesis protein  50.24 
 
 
215 aa  219  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2992  hypothetical protein  51.2 
 
 
210 aa  218  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.785259 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0758  putative ubiquinone biosynthesis protein  51.17 
 
 
216 aa  214  5.9999999999999996e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5108  putative ubiquinone biosynthesis protein  53.55 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0912  putative ubiquinone biosynthesis protein  47.87 
 
 
213 aa  210  1e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08400  hypothetical protein  50.24 
 
 
215 aa  206  3e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000581813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0796  hypothetical protein  49.76 
 
 
215 aa  204  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2163  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase Coq7  46.92 
 
 
207 aa  203  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0397519 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2734  hypothetical protein  45.62 
 
 
217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2854  hypothetical protein  46.92 
 
 
211 aa  194  6e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0171  putative ubiquinone biosynthesis protein  46.67 
 
 
209 aa  194  9e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2793  putative ubiquinone biosynthesis protein  48.36 
 
 
213 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00345509  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3099  hypothetical protein  45.16 
 
 
217 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0157  putative ubiquinone biosynthesis protein  45.97 
 
 
209 aa  192  3e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0647  putative ubiquinone biosynthesis protein  46.34 
 
 
207 aa  191  5e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028315  normal  0.0960904 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0341  putative ubiquinone biosynthesis protein  44.23 
 
 
226 aa  188  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2989  putative ubiquinone biosynthesis protein  45.5 
 
 
207 aa  188  5.999999999999999e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3138  putative ubiquinone biosynthesis protein  45.5 
 
 
207 aa  185  5e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176892  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04009  ubiquinone biosynthesis protein  46.63 
 
 
217 aa  181  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0790  ubiquinone biosynthesis protein  43.93 
 
 
237 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0029  hypothetical protein  45.54 
 
 
213 aa  179  2e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0938  putative ubiquinone biosynthesis protein  43.46 
 
 
214 aa  179  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.290926  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0877  ubiquinone biosynthesis protein  43.93 
 
 
220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00091351  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0520  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  44.23 
 
 
208 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0067  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  44.23 
 
 
208 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  44.23 
 
 
208 aa  178  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0028  hypothetical protein  45.54 
 
 
213 aa  178  4.999999999999999e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3712  ubiquinone biosynthesis protein  43.87 
 
 
214 aa  177  1e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0478  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  43.48 
 
 
208 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0453  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  43.48 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1305  putative ubiquinone biosynthesis protein  40.76 
 
 
208 aa  171  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3414  putative ubiquinone biosynthesis protein  44.5 
 
 
216 aa  171  9e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000230541 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0476  hypothetical protein  42.18 
 
 
212 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0683128  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3635  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  42.72 
 
 
208 aa  167  8e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0931  putative ubiquinone biosynthesis protein  41.26 
 
 
205 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2311  putative ubiquinone biosynthesis protein  42.18 
 
 
212 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3560  ubiquinone biosynthesis protein  41.75 
 
 
208 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3222  hypothetical protein  41.75 
 
 
208 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1341  hypothetical protein  41.75 
 
 
218 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638025  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0482  hypothetical protein  41.75 
 
 
218 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.687681  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3554  hypothetical protein  41.75 
 
 
208 aa  165  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.879086  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2561  hypothetical protein  41.75 
 
 
208 aa  165  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.647522  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3535  putative ubiquinone biosynthesis protein  41.75 
 
 
208 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2846  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  42.23 
 
 
208 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3480  hypothetical protein  41.71 
 
 
212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000518071  hitchhiker  0.00318876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0660  putative ubiquinone biosynthesis protein  42.23 
 
 
205 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0681  putative ubiquinone biosynthesis protein  42.23 
 
 
205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  0.131106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1230  ubiquinone biosynthesis protein  42.79 
 
 
206 aa  161  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000724094  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2683  hypothetical protein  45.7 
 
 
187 aa  160  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.936487  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3123  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase Coq7  42.99 
 
 
212 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000323953  normal  0.0502353 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1108  hypothetical protein  45.51 
 
 
186 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1087  putative ubiquinone biosynthesis protein  42.03 
 
 
209 aa  158  7e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5683  putative ubiquinone biosynthesis protein  40.78 
 
 
205 aa  157  2e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000723983  normal  0.587683 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0731  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ7  41.06 
 
 
210 aa  154  1e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2073  hypothetical protein  39.23 
 
 
215 aa  154  1e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000039677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0102  2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  39.23 
 
 
215 aa  153  2e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0745  putative ubiquinone biosynthesis protein  41.26 
 
 
214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.949494  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2840  ubiquinone biosynthesis protein  40.41 
 
 
208 aa  143  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000217276  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3239  Coq7 family protein  40.41 
 
 
208 aa  143  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0646  putative ubiquinone biosynthesis protein  39.9 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0873  Coq7 family protein  28.17 
 
 
170 aa  70.5  0.00000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0582866  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0225  Coq7 family protein  27.74 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0572  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  25.71 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.672721 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0339  Coq7 family protein  24.82 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0552133  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01210  ubiquinone metabolism-related protein, putative  25.27 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3198  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  26.09 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1634  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  24.65 
 
 
193 aa  60.5  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.663007  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  25.58 
 
 
163 aa  60.1  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.570699  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_002978  WD1100  Coq7 family protein  24.62 
 
 
180 aa  58.9  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.977471  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3498  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  26.47 
 
 
212 aa  58.2  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0153  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  28.57 
 
 
182 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2348  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  24.14 
 
 
193 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0053  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  22.73 
 
 
170 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73817  DMQ mono-oxygenase/Ubiquinone biosynthesis protein COQ7/CLK-1/CAT5  23.72 
 
 
251 aa  46.2  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.551295 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>