86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2734 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_2734  hypothetical protein  100 
 
 		 217 aa  437  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3099  hypothetical protein  96.77 
 
 		 217 aa  426  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2854  hypothetical protein  86.18 
 
 		 211 aa  381  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3138  putative ubiquinone biosynthesis protein  68.52 
 
 		 207 aa  304  8.000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2989  putative ubiquinone biosynthesis protein  69.91 
 
 		 207 aa  300  9e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0520  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  63.59 
 
 		 208 aa  277  7e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0478  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  63.59 
 
 		 208 aa  278  7e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0067  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  63.59 
 
 		 208 aa  277  7e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  63.59 
 
 		 208 aa  277  7e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0453  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  63.59 
 
 		 208 aa  276  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0476  hypothetical protein  61.29 
 
 		 212 aa  271  5.000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0683128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2846  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  63.13 
 
 		 208 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3635  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  61.75 
 
 		 208 aa  268  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3480  hypothetical protein  60.83 
 
 		 212 aa  266  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000518071  hitchhiker  0.00318876 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0157  putative ubiquinone biosynthesis protein  58.99 
 
 		 209 aa  265  2.9999999999999995e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0171  putative ubiquinone biosynthesis protein  61.11 
 
 		 209 aa  265  5e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3535  putative ubiquinone biosynthesis protein  60.83 
 
 		 208 aa  264  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3560  ubiquinone biosynthesis protein  60.83 
 
 		 208 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3222  hypothetical protein  60.83 
 
 		 208 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3554  hypothetical protein  60.83 
 
 		 208 aa  263  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.879086  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2561  hypothetical protein  60.83 
 
 		 208 aa  263  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.647522  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0482  hypothetical protein  60.83 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.687681  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1341  hypothetical protein  60.83 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638025  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3414  putative ubiquinone biosynthesis protein  59.26 
 
 		 216 aa  247  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000230541 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1108  hypothetical protein  67.66 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2683  hypothetical protein  66.47 
 
 		 187 aa  239  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.936487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2163  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase Coq7  56.94 
 
 		 207 aa  239  2.9999999999999997e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0397519 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04009  ubiquinone biosynthesis protein  60.65 
 
 		 217 aa  238  5e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0647  putative ubiquinone biosynthesis protein  54.88 
 
 		 207 aa  233  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028315  normal  0.0960904 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0931  putative ubiquinone biosynthesis protein  56.94 
 
 		 205 aa  232  3e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46070  Ubiquinone biosynthesis protein  53.7 
 
 		 215 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4776  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  51.61 
 
 		 215 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.564721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3712  ubiquinone biosynthesis protein  65.5 
 
 		 214 aa  225  4e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0460  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  51.61 
 
 		 215 aa  224  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  0.0120401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0427  hypothetical protein  52.07 
 
 		 215 aa  224  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0457  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  52.07 
 
 		 215 aa  224  8e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314163 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1305  putative ubiquinone biosynthesis protein  53.95 
 
 		 208 aa  224  8e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3941  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  51.15 
 
 		 215 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0938  putative ubiquinone biosynthesis protein  54.84 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.290926  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0341  putative ubiquinone biosynthesis protein  52.78 
 
 		 226 aa  223  2e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0790  ubiquinone biosynthesis protein  52.78 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0912  putative ubiquinone biosynthesis protein  55.09 
 
 		 213 aa  221  7e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0877  ubiquinone biosynthesis protein  52.31 
 
 		 220 aa  220  9.999999999999999e-57  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00091351  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3123  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase Coq7  56.28 
 
 		 212 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000323953  normal  0.0502353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1087  putative ubiquinone biosynthesis protein  63.37 
 
 		 209 aa  218  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0758  putative ubiquinone biosynthesis protein  49.08 
 
 		 216 aa  216  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1230  ubiquinone biosynthesis protein  54.84 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000724094  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2992  hypothetical protein  49.08 
 
 		 210 aa  214  8e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.785259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4574  hypothetical protein  48.39 
 
 		 215 aa  214  9e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0796  hypothetical protein  51.15 
 
 		 215 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08400  hypothetical protein  50.69 
 
 		 215 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000581813 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0745  putative ubiquinone biosynthesis protein  55.4 
 
 		 214 aa  212  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.949494  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0029  hypothetical protein  52.51 
 
 		 213 aa  211  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0028  hypothetical protein  52.05 
 
 		 213 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2793  putative ubiquinone biosynthesis protein  52.29 
 
 		 213 aa  209  2e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00345509  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2311  putative ubiquinone biosynthesis protein  51.38 
 
 		 212 aa  209  3e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0599  hypothetical protein  47.93 
 
 		 215 aa  208  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0681  putative ubiquinone biosynthesis protein  52.78 
 
 		 205 aa  207  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  0.131106 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0646  putative ubiquinone biosynthesis protein  54.63 
 
 		 209 aa  207  1e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0660  putative ubiquinone biosynthesis protein  52.78 
 
 		 205 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122518  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0731  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ7  52.56 
 
 		 210 aa  206  2e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5108  putative ubiquinone biosynthesis protein  48.39 
 
 		 215 aa  205  5e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2073  hypothetical protein  47.22 
 
 		 215 aa  202  4e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000039677  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5683  putative ubiquinone biosynthesis protein  53.7 
 
 		 205 aa  201  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000723983  normal  0.587683 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0102  2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  47.22 
 
 		 215 aa  201  6e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0926  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  45.87 
 
 		 213 aa  201  9e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1512  ubiquinone biosyntheis protein COQ7  45.62 
 
 		 214 aa  197  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1691  putative ubiquinone biosyntheis protein COQ7  44.7 
 
 		 214 aa  192  3e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.150578  normal  0.801245 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3239  Coq7 family protein  48.15 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2840  ubiquinone biosynthesis protein  48.15 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000217276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1634  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  31.36 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.663007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3198  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  34.15 
 
 		 186 aa  81.3  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0572  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  30.77 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.672721 
 
 
-
 
NC_006686  CND01210  ubiquinone metabolism-related protein, putative  27.89 
 
 		 251 aa  72.4  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0225  Coq7 family protein  25.32 
 
 		 170 aa  72  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3498  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  29.45 
 
 		 212 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0873  Coq7 family protein  25.47 
 
 		 170 aa  67  0.0000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0582866  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0053  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  32.73 
 
 		 170 aa  65.1  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2348  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  29.94 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0339  Coq7 family protein  26.52 
 
 		 175 aa  63.9  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0552133  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1100  Coq7 family protein  24.71 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  27.91 
 
 		 163 aa  59.3  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.570699  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0153  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  26.87 
 
 		 182 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2238  Ubiquinone biosynthesis protein COQ7  27.34 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73817  DMQ mono-oxygenase/Ubiquinone biosynthesis protein COQ7/CLK-1/CAT5  27.78 
 
 		 251 aa  51.6  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.551295 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04569  ubiquinone biosynthesis protein Coq7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01890)  24.87 
 
 		 240 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.806662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>