85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5108 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5108  putative ubiquinone biosynthesis protein  100 
 
 		 215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0427  hypothetical protein  86.98 
 
 		 215 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0460  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  87.44 
 
 		 215 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  0.0120401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4776  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  86.51 
 
 		 215 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.564721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0457  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  86.51 
 
 		 215 aa  396  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314163 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0599  hypothetical protein  87.91 
 
 		 215 aa  390  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4574  hypothetical protein  84.65 
 
 		 215 aa  381  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3941  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  80.47 
 
 		 215 aa  369  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46070  Ubiquinone biosynthesis protein  78.14 
 
 		 215 aa  358  3e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08400  hypothetical protein  81.4 
 
 		 215 aa  357  8e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000581813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0796  hypothetical protein  80.47 
 
 		 215 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0912  putative ubiquinone biosynthesis protein  60.19 
 
 		 213 aa  268  5e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0758  putative ubiquinone biosynthesis protein  60.66 
 
 		 216 aa  266  1e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2992  hypothetical protein  60.58 
 
 		 210 aa  262  2e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.785259 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0926  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  53.08 
 
 		 213 aa  235  5.0000000000000005e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0938  putative ubiquinone biosynthesis protein  53.74 
 
 		 214 aa  228  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.290926  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1512  ubiquinone biosyntheis protein COQ7  53.55 
 
 		 214 aa  228  6e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1691  putative ubiquinone biosyntheis protein COQ7  53.59 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.150578  normal  0.801245 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2163  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase Coq7  52.4 
 
 		 207 aa  221  8e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0397519 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0171  putative ubiquinone biosynthesis protein  50.24 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2793  putative ubiquinone biosynthesis protein  52.83 
 
 		 213 aa  220  9.999999999999999e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00345509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0647  putative ubiquinone biosynthesis protein  51.22 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028315  normal  0.0960904 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0157  putative ubiquinone biosynthesis protein  50.71 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2734  hypothetical protein  48.39 
 
 		 217 aa  215  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0341  putative ubiquinone biosynthesis protein  50.49 
 
 		 226 aa  214  9e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2854  hypothetical protein  51.18 
 
 		 211 aa  213  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3138  putative ubiquinone biosynthesis protein  51.21 
 
 		 207 aa  214  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176892  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0028  hypothetical protein  53.3 
 
 		 213 aa  213  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0029  hypothetical protein  53.3 
 
 		 213 aa  214  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3099  hypothetical protein  48.39 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04009  ubiquinone biosynthesis protein  50.23 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2989  putative ubiquinone biosynthesis protein  52.4 
 
 		 207 aa  209  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3480  hypothetical protein  46.92 
 
 		 212 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000518071  hitchhiker  0.00318876 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0476  hypothetical protein  47.39 
 
 		 212 aa  196  3e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0683128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0478  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  47.8 
 
 		 208 aa  194  9e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3414  putative ubiquinone biosynthesis protein  48.4 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000230541 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0453  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  47.8 
 
 		 208 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0067  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  47.32 
 
 		 208 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  47.32 
 
 		 208 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0520  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  47.32 
 
 		 208 aa  192  4e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1230  ubiquinone biosynthesis protein  46.6 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000724094  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0931  putative ubiquinone biosynthesis protein  46.15 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2683  hypothetical protein  50 
 
 		 187 aa  190  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.936487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2311  putative ubiquinone biosynthesis protein  47.64 
 
 		 212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1341  hypothetical protein  46.19 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638025  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1305  putative ubiquinone biosynthesis protein  44.71 
 
 		 208 aa  188  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0482  hypothetical protein  46.19 
 
 		 218 aa  188  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.687681  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3222  hypothetical protein  47.06 
 
 		 208 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2561  hypothetical protein  47.06 
 
 		 208 aa  187  9e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.647522  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3535  putative ubiquinone biosynthesis protein  47.06 
 
 		 208 aa  187  1e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3712  ubiquinone biosynthesis protein  47.69 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2073  hypothetical protein  46.33 
 
 		 215 aa  186  2e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000039677  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0102  2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  46.33 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0790  ubiquinone biosynthesis protein  44.24 
 
 		 237 aa  186  3e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3554  hypothetical protein  46.57 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.879086  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3560  ubiquinone biosynthesis protein  46.57 
 
 		 208 aa  185  4e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2846  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  46.08 
 
 		 208 aa  184  7e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0877  ubiquinone biosynthesis protein  43.78 
 
 		 220 aa  184  7e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00091351  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3635  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  46.08 
 
 		 208 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1108  hypothetical protein  52.73 
 
 		 186 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1087  putative ubiquinone biosynthesis protein  48.56 
 
 		 209 aa  181  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0681  putative ubiquinone biosynthesis protein  47.6 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  0.131106 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0660  putative ubiquinone biosynthesis protein  47.6 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122518  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3123  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase Coq7  46.23 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000323953  normal  0.0502353 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0731  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ7  45.37 
 
 		 210 aa  167  1e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0745  putative ubiquinone biosynthesis protein  45.59 
 
 		 214 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.949494  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5683  putative ubiquinone biosynthesis protein  46.6 
 
 		 205 aa  162  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000723983  normal  0.587683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3239  Coq7 family protein  40.49 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2840  ubiquinone biosynthesis protein  40.49 
 
 		 208 aa  161  6e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000217276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0646  putative ubiquinone biosynthesis protein  46.15 
 
 		 209 aa  161  9e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0572  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  27.4 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.672721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1634  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  28.57 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.663007  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND01210  ubiquinone metabolism-related protein, putative  26.63 
 
 		 251 aa  61.6  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0053  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  30.87 
 
 		 170 aa  61.6  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  25.62 
 
 		 163 aa  60.5  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.570699  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73817  DMQ mono-oxygenase/Ubiquinone biosynthesis protein COQ7/CLK-1/CAT5  31.25 
 
 		 251 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0339  Coq7 family protein  26.67 
 
 		 175 aa  52.4  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0552133  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2348  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  27.44 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3498  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  23.81 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3198  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  23.56 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.470214 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04569  ubiquinone biosynthesis protein Coq7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01890)  23.53 
 
 		 240 aa  49.3  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.806662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1100  Coq7 family protein  23.03 
 
 		 180 aa  47  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.977471  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0225  Coq7 family protein  22.31 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0873  Coq7 family protein  23.08 
 
 		 170 aa  46.2  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0582866  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0153  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  22.39 
 
 		 182 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>