85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_0926 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_0926  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  100 
 
 
213 aa  442  1e-123  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222841  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1512  ubiquinone biosyntheis protein COQ7  78.2 
 
 
214 aa  352  2e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1691  putative ubiquinone biosyntheis protein COQ7  77.25 
 
 
214 aa  347  7e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.150578  normal  0.801245 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3941  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  53.08 
 
 
215 aa  240  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0457  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  51.66 
 
 
215 aa  235  3e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.314163 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4776  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  50.24 
 
 
215 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.564721 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0460  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  51.18 
 
 
215 aa  234  6e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  0.0120401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0427  hypothetical protein  50.71 
 
 
215 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46070  Ubiquinone biosynthesis protein  51.18 
 
 
215 aa  229  2e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0599  hypothetical protein  52.61 
 
 
215 aa  229  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4574  hypothetical protein  51.18 
 
 
215 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2992  hypothetical protein  50.24 
 
 
210 aa  221  4e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.785259 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5108  putative ubiquinone biosynthesis protein  53.08 
 
 
215 aa  218  6e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08400  hypothetical protein  51.66 
 
 
215 aa  217  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000581813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0796  hypothetical protein  50.71 
 
 
215 aa  215  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0758  putative ubiquinone biosynthesis protein  49.53 
 
 
216 aa  214  8e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0157  putative ubiquinone biosynthesis protein  47.62 
 
 
209 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0912  putative ubiquinone biosynthesis protein  47.42 
 
 
213 aa  204  1e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2734  hypothetical protein  45.87 
 
 
217 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2163  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase Coq7  45.02 
 
 
207 aa  200  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0397519 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0171  putative ubiquinone biosynthesis protein  46.19 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3099  hypothetical protein  45.87 
 
 
217 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2793  putative ubiquinone biosynthesis protein  47.64 
 
 
213 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00345509  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0647  putative ubiquinone biosynthesis protein  44.39 
 
 
207 aa  198  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028315  normal  0.0960904 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2854  hypothetical protein  46.7 
 
 
211 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3138  putative ubiquinone biosynthesis protein  47.83 
 
 
207 aa  192  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176892  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2989  putative ubiquinone biosynthesis protein  49.04 
 
 
207 aa  190  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0341  putative ubiquinone biosynthesis protein  44.12 
 
 
226 aa  191  1e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0938  putative ubiquinone biosynthesis protein  44.76 
 
 
214 aa  186  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.290926  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0476  hypothetical protein  43.87 
 
 
212 aa  182  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0683128  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0520  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  44.5 
 
 
208 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  44.5 
 
 
208 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0067  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  44.5 
 
 
208 aa  182  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0790  ubiquinone biosynthesis protein  48.35 
 
 
237 aa  182  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0877  ubiquinone biosynthesis protein  48.35 
 
 
220 aa  181  5.0000000000000004e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00091351  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0478  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  43.27 
 
 
208 aa  179  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0453  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  43.27 
 
 
208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04009  ubiquinone biosynthesis protein  45.45 
 
 
217 aa  179  4e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0029  hypothetical protein  45.45 
 
 
213 aa  174  9.999999999999999e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0028  hypothetical protein  45.45 
 
 
213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3635  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  42.51 
 
 
208 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1341  hypothetical protein  41.23 
 
 
218 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638025  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0482  hypothetical protein  41.23 
 
 
218 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.687681  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3712  ubiquinone biosynthesis protein  46.82 
 
 
214 aa  169  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2846  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  42.03 
 
 
208 aa  169  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3414  putative ubiquinone biosynthesis protein  43.06 
 
 
216 aa  170  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000230541 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1230  ubiquinone biosynthesis protein  42.03 
 
 
206 aa  169  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000724094  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3535  putative ubiquinone biosynthesis protein  41.55 
 
 
208 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3560  ubiquinone biosynthesis protein  41.55 
 
 
208 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3480  hypothetical protein  41.98 
 
 
212 aa  169  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000518071  hitchhiker  0.00318876 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3554  hypothetical protein  41.55 
 
 
208 aa  169  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.879086  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2561  hypothetical protein  41.55 
 
 
208 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.647522  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3222  hypothetical protein  41.55 
 
 
208 aa  169  4e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2683  hypothetical protein  45.7 
 
 
187 aa  168  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.936487  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1305  putative ubiquinone biosynthesis protein  40.67 
 
 
208 aa  168  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2311  putative ubiquinone biosynthesis protein  42.38 
 
 
212 aa  166  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2073  hypothetical protein  40.95 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000039677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1108  hypothetical protein  44.91 
 
 
186 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0102  2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  40.95 
 
 
215 aa  162  3e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1087  putative ubiquinone biosynthesis protein  39.9 
 
 
209 aa  161  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0931  putative ubiquinone biosynthesis protein  39.42 
 
 
205 aa  160  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0681  putative ubiquinone biosynthesis protein  40.78 
 
 
205 aa  158  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  0.131106 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0660  putative ubiquinone biosynthesis protein  40.29 
 
 
205 aa  158  7e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122518  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3123  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase Coq7  42.25 
 
 
212 aa  155  6e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000323953  normal  0.0502353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0745  putative ubiquinone biosynthesis protein  42.23 
 
 
214 aa  154  7e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.949494  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0646  putative ubiquinone biosynthesis protein  40.48 
 
 
209 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0731  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ7  40 
 
 
210 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5683  putative ubiquinone biosynthesis protein  38.83 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000723983  normal  0.587683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3239  Coq7 family protein  38.22 
 
 
208 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2840  ubiquinone biosynthesis protein  38.22 
 
 
208 aa  142  4e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000217276  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0572  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  26.76 
 
 
171 aa  71.2  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.672721 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1634  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  26.57 
 
 
193 aa  70.9  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.663007  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0873  Coq7 family protein  28.99 
 
 
170 aa  67.8  0.0000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0582866  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0225  Coq7 family protein  25.76 
 
 
170 aa  68.2  0.0000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1100  Coq7 family protein  25.17 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  26.36 
 
 
163 aa  65.1  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.570699  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0339  Coq7 family protein  26.76 
 
 
175 aa  61.2  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0552133  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3198  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  27.27 
 
 
186 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0053  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  27.21 
 
 
170 aa  57.8  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2348  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  24.49 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND01210  ubiquinone metabolism-related protein, putative  23.49 
 
 
251 aa  57.4  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3498  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  23.36 
 
 
212 aa  56.6  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0153  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  23.88 
 
 
182 aa  51.6  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73817  DMQ mono-oxygenase/Ubiquinone biosynthesis protein COQ7/CLK-1/CAT5  22.06 
 
 
251 aa  48.9  0.00006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.551295 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04569  ubiquinone biosynthesis protein Coq7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01890)  22.81 
 
 
240 aa  46.2  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.806662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>