85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3941 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3941  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  100 
 
 		 215 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0457  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  84.19 
 
 		 215 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0427  hypothetical protein  83.26 
 
 		 215 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0460  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  83.26 
 
 		 215 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  0.0120401 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4776  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  82.79 
 
 		 215 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.564721 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46070  Ubiquinone biosynthesis protein  81.4 
 
 		 215 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0599  hypothetical protein  80 
 
 		 215 aa  361  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08400  hypothetical protein  82.33 
 
 		 215 aa  360  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000581813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0796  hypothetical protein  81.4 
 
 		 215 aa  358  3e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4574  hypothetical protein  78.6 
 
 		 215 aa  357  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5108  putative ubiquinone biosynthesis protein  80.47 
 
 		 215 aa  350  8e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0758  putative ubiquinone biosynthesis protein  63.26 
 
 		 216 aa  281  7.000000000000001e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2992  hypothetical protein  62.5 
 
 		 210 aa  272  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.785259 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0912  putative ubiquinone biosynthesis protein  61.14 
 
 		 213 aa  268  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0926  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  53.08 
 
 		 213 aa  240  1e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222841  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2854  hypothetical protein  55.45 
 
 		 211 aa  229  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0157  putative ubiquinone biosynthesis protein  53.33 
 
 		 209 aa  229  3e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0938  putative ubiquinone biosynthesis protein  54.5 
 
 		 214 aa  228  4e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.290926  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1512  ubiquinone biosyntheis protein COQ7  52.13 
 
 		 214 aa  228  6e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0171  putative ubiquinone biosynthesis protein  51.2 
 
 		 209 aa  226  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3138  putative ubiquinone biosynthesis protein  53.14 
 
 		 207 aa  226  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2163  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase Coq7  55.29 
 
 		 207 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0397519 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1691  putative ubiquinone biosyntheis protein COQ7  51.66 
 
 		 214 aa  223  2e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.150578  normal  0.801245 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2734  hypothetical protein  51.15 
 
 		 217 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0029  hypothetical protein  55.66 
 
 		 213 aa  222  3e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0028  hypothetical protein  55.66 
 
 		 213 aa  222  4e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3099  hypothetical protein  51.15 
 
 		 217 aa  221  7e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2989  putative ubiquinone biosynthesis protein  55.24 
 
 		 207 aa  216  1e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2793  putative ubiquinone biosynthesis protein  52.83 
 
 		 213 aa  214  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00345509  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0341  putative ubiquinone biosynthesis protein  51.17 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0476  hypothetical protein  51.18 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0683128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0647  putative ubiquinone biosynthesis protein  51.22 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028315  normal  0.0960904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04009  ubiquinone biosynthesis protein  52.13 
 
 		 217 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1305  putative ubiquinone biosynthesis protein  48.56 
 
 		 208 aa  201  8e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0931  putative ubiquinone biosynthesis protein  49.03 
 
 		 205 aa  200  9.999999999999999e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3414  putative ubiquinone biosynthesis protein  49.76 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000230541 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0478  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  49.28 
 
 		 208 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3480  hypothetical protein  48.36 
 
 		 212 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000518071  hitchhiker  0.00318876 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0453  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  49.28 
 
 		 208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0067  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  49.28 
 
 		 208 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  49.28 
 
 		 208 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0520  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  49.28 
 
 		 208 aa  198  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2846  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  48.06 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3635  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  47.8 
 
 		 208 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3222  hypothetical protein  48.78 
 
 		 208 aa  194  7e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2561  hypothetical protein  48.78 
 
 		 208 aa  194  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.647522  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1341  hypothetical protein  47.42 
 
 		 218 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638025  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0482  hypothetical protein  47.42 
 
 		 218 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.687681  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2683  hypothetical protein  52.2 
 
 		 187 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.936487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3535  putative ubiquinone biosynthesis protein  48.29 
 
 		 208 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3554  hypothetical protein  47.8 
 
 		 208 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.879086  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3560  ubiquinone biosynthesis protein  47.8 
 
 		 208 aa  191  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3712  ubiquinone biosynthesis protein  48.17 
 
 		 214 aa  189  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2311  putative ubiquinone biosynthesis protein  47.64 
 
 		 212 aa  190  2e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2073  hypothetical protein  47.42 
 
 		 215 aa  189  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000039677  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1108  hypothetical protein  52.69 
 
 		 186 aa  188  5e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0102  2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  47.42 
 
 		 215 aa  188  7e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0790  ubiquinone biosynthesis protein  45.07 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0877  ubiquinone biosynthesis protein  44.6 
 
 		 220 aa  185  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00091351  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1087  putative ubiquinone biosynthesis protein  51.92 
 
 		 209 aa  184  9e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1230  ubiquinone biosynthesis protein  47.09 
 
 		 206 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000724094  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0660  putative ubiquinone biosynthesis protein  48.56 
 
 		 205 aa  181  6e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0681  putative ubiquinone biosynthesis protein  48.56 
 
 		 205 aa  181  8.000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  0.131106 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0745  putative ubiquinone biosynthesis protein  47.89 
 
 		 214 aa  175  4e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.949494  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0731  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ7  47.8 
 
 		 210 aa  174  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3239  Coq7 family protein  42.93 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2840  ubiquinone biosynthesis protein  42.93 
 
 		 208 aa  169  2e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000217276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3123  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase Coq7  46.23 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000323953  normal  0.0502353 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5683  putative ubiquinone biosynthesis protein  47.09 
 
 		 205 aa  168  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000723983  normal  0.587683 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0646  putative ubiquinone biosynthesis protein  49.04 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1634  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  30 
 
 		 193 aa  72.4  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.663007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  26.88 
 
 		 163 aa  68.6  0.00000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.570699  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0572  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  27.39 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.672721 
 
 
-
 
NC_006686  CND01210  ubiquinone metabolism-related protein, putative  25.65 
 
 		 251 aa  63.5  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0339  Coq7 family protein  27.4 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0552133  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0053  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  29.73 
 
 		 170 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3498  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  24.2 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73817  DMQ mono-oxygenase/Ubiquinone biosynthesis protein COQ7/CLK-1/CAT5  28.24 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.551295 
 
 
-
 
NC_002978  WD1100  Coq7 family protein  21.69 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.977471  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0873  Coq7 family protein  22.9 
 
 		 170 aa  54.7  0.000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0582866  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0225  Coq7 family protein  20.61 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04569  ubiquinone biosynthesis protein Coq7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01890)  25.78 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.806662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0153  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  25.19 
 
 		 182 aa  52  0.000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2348  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  26.63 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3198  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  23.12 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.470214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>