86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0938 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0938  putative ubiquinone biosynthesis protein  100 
 
 
214 aa  439  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.290926  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2793  putative ubiquinone biosynthesis protein  57.08 
 
 
213 aa  249  3e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00345509  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0758  putative ubiquinone biosynthesis protein  55.19 
 
 
216 aa  233  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.276204 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0341  putative ubiquinone biosynthesis protein  54.55 
 
 
226 aa  233  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4776  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  54.67 
 
 
215 aa  231  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.564721 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0457  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  54.21 
 
 
215 aa  229  3e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.314163 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3941  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  54.5 
 
 
215 aa  228  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0427  hypothetical protein  53.74 
 
 
215 aa  228  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0171  putative ubiquinone biosynthesis protein  53.81 
 
 
209 aa  228  7e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0599  hypothetical protein  52.61 
 
 
215 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0460  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  53.74 
 
 
215 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.485558  normal  0.0120401 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4574  hypothetical protein  52.13 
 
 
215 aa  225  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0157  putative ubiquinone biosynthesis protein  53.33 
 
 
209 aa  224  6e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2989  putative ubiquinone biosynthesis protein  56.25 
 
 
207 aa  224  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2311  putative ubiquinone biosynthesis protein  55.19 
 
 
212 aa  224  7e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2734  hypothetical protein  54.84 
 
 
217 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2992  hypothetical protein  52.15 
 
 
210 aa  222  3e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.324606  normal  0.785259 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3138  putative ubiquinone biosynthesis protein  54.81 
 
 
207 aa  222  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.176892  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0029  hypothetical protein  57.55 
 
 
213 aa  222  4e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0028  hypothetical protein  56.6 
 
 
213 aa  219  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3099  hypothetical protein  53.92 
 
 
217 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2854  hypothetical protein  55.45 
 
 
211 aa  218  7e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0912  putative ubiquinone biosynthesis protein  52.13 
 
 
213 aa  218  7e-56  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46070  Ubiquinone biosynthesis protein  53.08 
 
 
215 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2163  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase Coq7  52.63 
 
 
207 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0397519 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1305  putative ubiquinone biosynthesis protein  48.8 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.357891 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2073  hypothetical protein  49.29 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000039677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5108  putative ubiquinone biosynthesis protein  53.74 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0102  2-polyprenyl-3-methyl-6-methoxy-1,4-benzoquinol hydroxylase  49.29 
 
 
215 aa  212  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.398039  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0931  putative ubiquinone biosynthesis protein  50 
 
 
205 aa  207  9e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.694981  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0796  hypothetical protein  52.34 
 
 
215 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08400  hypothetical protein  51.87 
 
 
215 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000581813 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0478  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  50 
 
 
208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2846  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  49.51 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.188656  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0453  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  50 
 
 
208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.633447  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0647  putative ubiquinone biosynthesis protein  48.77 
 
 
207 aa  198  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000028315  normal  0.0960904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04009  ubiquinone biosynthesis protein  49.51 
 
 
217 aa  198  6e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0790  ubiquinone biosynthesis protein  47.2 
 
 
237 aa  198  6e-50  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0877  ubiquinone biosynthesis protein  46.73 
 
 
220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00091351  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  48.06 
 
 
208 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0067  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  48.06 
 
 
208 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0520  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  48.06 
 
 
208 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3635  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like  48.54 
 
 
208 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2561  hypothetical protein  48.54 
 
 
208 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.647522  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3414  putative ubiquinone biosynthesis protein  50.24 
 
 
216 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000230541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3480  hypothetical protein  50.24 
 
 
212 aa  193  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000518071  hitchhiker  0.00318876 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3222  hypothetical protein  48.54 
 
 
208 aa  194  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0482  hypothetical protein  48.54 
 
 
218 aa  193  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.687681  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0476  hypothetical protein  49.29 
 
 
212 aa  193  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0683128  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1341  hypothetical protein  48.54 
 
 
218 aa  193  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.638025  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3560  ubiquinone biosynthesis protein  48.06 
 
 
208 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3554  hypothetical protein  48.06 
 
 
208 aa  192  2e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.879086  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1230  ubiquinone biosynthesis protein  50.98 
 
 
206 aa  192  3e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000724094  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5683  putative ubiquinone biosynthesis protein  51.46 
 
 
205 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000723983  normal  0.587683 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3535  putative ubiquinone biosynthesis protein  48.06 
 
 
208 aa  192  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0745  putative ubiquinone biosynthesis protein  49.51 
 
 
214 aa  189  2e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.949494  normal  0.750884 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0731  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase COQ7  51.22 
 
 
210 aa  188  4e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0660  putative ubiquinone biosynthesis protein  48.06 
 
 
205 aa  188  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.122518  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0681  putative ubiquinone biosynthesis protein  47.57 
 
 
205 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.593749  normal  0.131106 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0926  ubiquinone biosynthesis protein COQ7-like protein  44.76 
 
 
213 aa  186  2e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000222841  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1087  putative ubiquinone biosynthesis protein  52.88 
 
 
209 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.57185  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1108  hypothetical protein  52.1 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2683  hypothetical protein  51.67 
 
 
187 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.936487  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2840  ubiquinone biosynthesis protein  46.34 
 
 
208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000217276  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3239  Coq7 family protein  46.34 
 
 
208 aa  181  5.0000000000000004e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0578538  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1512  ubiquinone biosyntheis protein COQ7  43.46 
 
 
214 aa  179  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3123  putative ubiquinone biosynthesis monooxygenase Coq7  48.58 
 
 
212 aa  179  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.000323953  normal  0.0502353 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1691  putative ubiquinone biosyntheis protein COQ7  43.4 
 
 
214 aa  179  4e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.150578  normal  0.801245 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3712  ubiquinone biosynthesis protein  45.97 
 
 
214 aa  175  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.151258  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0646  putative ubiquinone biosynthesis protein  48.56 
 
 
209 aa  174  6e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.112408  normal  0.336917 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1634  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  29.34 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.663007  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3498  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  24.84 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00704542  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0572  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  25.17 
 
 
171 aa  60.8  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.672721 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3198  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  27.16 
 
 
186 aa  57.8  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.470214 
 
 
-
 
NC_006686  CND01210  ubiquinone metabolism-related protein, putative  24.74 
 
 
251 aa  57.8  0.0000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2549  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  25.98 
 
 
163 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.570699  normal  0.287563 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0339  Coq7 family protein  25.95 
 
 
175 aa  55.8  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0552133  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0225  Coq7 family protein  21.54 
 
 
170 aa  52  0.000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0053  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  24.62 
 
 
170 aa  51.6  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2238  Ubiquinone biosynthesis protein COQ7  28.12 
 
 
198 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2348  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  25.9 
 
 
193 aa  48.9  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1100  Coq7 family protein  21.85 
 
 
180 aa  48.1  0.00009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.977471  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0153  ubiquinone biosynthesis protein COQ7  22.9 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01779  Coq7 family protein  22.86 
 
 
192 aa  47.8  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0873  Coq7 family protein  20 
 
 
170 aa  46.6  0.0003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0582866  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04569  ubiquinone biosynthesis protein Coq7, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01890)  23.17 
 
 
240 aa  41.6  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.806662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>