41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1178 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1178  membrane protein-like protein  100 
 
 		 138 aa  275  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0731  hypothetical protein  57.35 
 
 		 136 aa  175  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0742  hypothetical protein  55.97 
 
 		 136 aa  171  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0091  hypothetical protein  40.5 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0462  hypothetical protein  38.35 
 
 		 133 aa  87.8  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1353  hypothetical protein  35.94 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247445 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0899  putative transmembrane protein  36.07 
 
 		 143 aa  82  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1447  hypothetical protein  38.02 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4836  membrane-like protein  39.82 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0388  hypothetical protein  36.7 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.965904  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2042  hypothetical protein  37.61 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0848  membrane protein-like protein  35.14 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2439  hypothetical protein  35.9 
 
 		 135 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2326  hypothetical protein  36.04 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306612  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0969  hypothetical protein  36.36 
 
 		 133 aa  70.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.7704  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1340  hypothetical protein  32.74 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1552  hypothetical protein  37.96 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.890317  normal  0.840659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3784  hypothetical protein  31.9 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637465  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1594  hypothetical protein  30.36 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3588  hypothetical protein  31.4 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3568  hypothetical protein  37.74 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0351  hypothetical protein  31.03 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1122  hypothetical protein  34.92 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0934652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0943  hypothetical protein  34.62 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2028  hypothetical protein  27.97 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1054  hypothetical protein  29.36 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1193  hypothetical protein  33.86 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2251  hypothetical protein  29.2 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0261  hypothetical protein  30.97 
 
 		 137 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3355  hypothetical protein  28.33 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0266  hypothetical protein  31.25 
 
 		 137 aa  53.5  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3561  hypothetical protein  34.51 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2028  membrane protein-like protein  26.92 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3216  hypothetical protein  31 
 
 		 135 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4918  hypothetical protein  29.84 
 
 		 133 aa  51.2  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.484884 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2255  hypothetical protein  31.43 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.165293  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2331  hypothetical protein  30.56 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0417022  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02774  hypothetical protein  27.59 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3097  hypothetical protein  28.95 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23708  normal  0.0273238 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0130  hypothetical protein  28.91 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4085  hypothetical protein  30.36 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>