45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0969 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0969  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  253  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.7704  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1122  hypothetical protein  89.47 
 
 
133 aa  204  3e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0934652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0899  putative transmembrane protein  53.6 
 
 
143 aa  137  6e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0091  hypothetical protein  51.18 
 
 
133 aa  129  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1594  hypothetical protein  48.87 
 
 
134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3784  hypothetical protein  49.23 
 
 
133 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637465  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1447  hypothetical protein  51.54 
 
 
129 aa  117  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2439  hypothetical protein  45 
 
 
135 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4836  membrane-like protein  41.98 
 
 
135 aa  110  6e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0351  hypothetical protein  45.97 
 
 
136 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1353  hypothetical protein  45.22 
 
 
133 aa  107  8.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0247445 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2028  hypothetical protein  41.41 
 
 
133 aa  100  5e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2326  hypothetical protein  44.14 
 
 
129 aa  95.5  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306612  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0462  hypothetical protein  39.34 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0388  hypothetical protein  41.96 
 
 
134 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.965904  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2042  hypothetical protein  41.96 
 
 
134 aa  87.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0848  membrane protein-like protein  41.96 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3561  hypothetical protein  51.55 
 
 
134 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1552  hypothetical protein  50.48 
 
 
136 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.890317  normal  0.840659 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1340  hypothetical protein  36.7 
 
 
120 aa  85.1  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1178  membrane protein-like protein  36.36 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0731  hypothetical protein  36 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356559  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1193  hypothetical protein  39.84 
 
 
135 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4085  hypothetical protein  43.08 
 
 
131 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2251  hypothetical protein  38.26 
 
 
135 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0742  hypothetical protein  34.4 
 
 
136 aa  77  0.00000000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0261  hypothetical protein  38.4 
 
 
137 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0266  hypothetical protein  36.8 
 
 
137 aa  75.1  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2028  membrane protein-like protein  37.69 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2255  hypothetical protein  41.67 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.165293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3588  hypothetical protein  32.28 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3568  hypothetical protein  45 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0763  hypothetical protein  39.62 
 
 
133 aa  71.2  0.000000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0276649  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02774  hypothetical protein  34.71 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2331  hypothetical protein  40 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0417022  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0689  hypothetical protein  38.53 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0130  hypothetical protein  35.54 
 
 
138 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_669  hypothetical protein  40 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.209076  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3355  hypothetical protein  33.08 
 
 
159 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4918  hypothetical protein  33.33 
 
 
133 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.484884 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0943  hypothetical protein  34.41 
 
 
143 aa  64.7  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3216  hypothetical protein  33.33 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488544  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3097  hypothetical protein  31.5 
 
 
132 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23708  normal  0.0273238 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1054  hypothetical protein  30.4 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2365  hypothetical protein  33.06 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.841985  normal  0.667316 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>