40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1054 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1054  hypothetical protein  100 
 
 
142 aa  277  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0943  hypothetical protein  67.13 
 
 
143 aa  164  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2439  hypothetical protein  42.37 
 
 
135 aa  92.4  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2326  hypothetical protein  43.09 
 
 
129 aa  84  7e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4836  membrane-like protein  37.27 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1353  hypothetical protein  36.11 
 
 
133 aa  78.2  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0247445 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0462  hypothetical protein  39.05 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0091  hypothetical protein  34.51 
 
 
133 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0899  putative transmembrane protein  33.64 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1340  hypothetical protein  31.15 
 
 
120 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2028  hypothetical protein  33.63 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1193  hypothetical protein  40.35 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0351  hypothetical protein  36.11 
 
 
136 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3568  hypothetical protein  35 
 
 
139 aa  62  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1447  hypothetical protein  34.45 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1594  hypothetical protein  32.84 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2255  hypothetical protein  39.6 
 
 
132 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.165293  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1552  hypothetical protein  32.71 
 
 
136 aa  60.5  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.890317  normal  0.840659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3588  hypothetical protein  37.04 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4918  hypothetical protein  40.21 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.484884 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3784  hypothetical protein  30.77 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637465  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3561  hypothetical protein  38.3 
 
 
134 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1178  membrane protein-like protein  29.36 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0388  hypothetical protein  29.31 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.965904  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0731  hypothetical protein  28.35 
 
 
136 aa  55.1  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356559  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0742  hypothetical protein  27.56 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2028  membrane protein-like protein  32.56 
 
 
138 aa  54.7  0.0000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0848  membrane protein-like protein  28.3 
 
 
134 aa  53.9  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2042  hypothetical protein  28.45 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3355  hypothetical protein  36.21 
 
 
159 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2251  hypothetical protein  28.07 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0969  hypothetical protein  30.09 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.7704  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3216  hypothetical protein  31.25 
 
 
135 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488544  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0261  hypothetical protein  31.67 
 
 
137 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0266  hypothetical protein  30 
 
 
137 aa  44.7  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3097  hypothetical protein  31.85 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23708  normal  0.0273238 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2365  hypothetical protein  34.81 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.841985  normal  0.667316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1122  hypothetical protein  27.73 
 
 
133 aa  42.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0934652 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02774  hypothetical protein  25.81 
 
 
145 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4085  hypothetical protein  26.15 
 
 
131 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>