39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0130 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0130  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  274  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2331  hypothetical protein  59.29 
 
 		 138 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0417022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0899  putative transmembrane protein  44.92 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0689  hypothetical protein  40.17 
 
 		 133 aa  88.6  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0763  hypothetical protein  40.87 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0276649  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_669  hypothetical protein  40.18 
 
 		 133 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.209076  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0091  hypothetical protein  41.12 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0261  hypothetical protein  31.11 
 
 		 137 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0266  hypothetical protein  30.37 
 
 		 137 aa  77.4  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2439  hypothetical protein  35.83 
 
 		 135 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1193  hypothetical protein  34.56 
 
 		 135 aa  68.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1353  hypothetical protein  34.85 
 
 		 133 aa  66.2  0.0000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247445 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1594  hypothetical protein  35.77 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3355  hypothetical protein  28.93 
 
 		 159 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0969  hypothetical protein  34.85 
 
 		 133 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.7704  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0351  hypothetical protein  29.1 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2326  hypothetical protein  35.4 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306612  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3784  hypothetical protein  36.11 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637465  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1122  hypothetical protein  33.88 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0934652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4918  hypothetical protein  30.53 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.484884 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3588  hypothetical protein  30.83 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2028  hypothetical protein  31.13 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2028  membrane protein-like protein  34.62 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0848  membrane protein-like protein  29.84 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4836  membrane-like protein  33.05 
 
 		 135 aa  52  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0462  hypothetical protein  28.93 
 
 		 133 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0731  hypothetical protein  30.16 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1447  hypothetical protein  36.79 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2042  hypothetical protein  29.03 
 
 		 134 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0388  hypothetical protein  29.03 
 
 		 134 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.965904  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0742  hypothetical protein  32.28 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2251  hypothetical protein  34.78 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3561  hypothetical protein  35.58 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1340  hypothetical protein  28.57 
 
 		 120 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1178  membrane protein-like protein  28.91 
 
 		 138 aa  44.3  0.0006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1552  hypothetical protein  44.68 
 
 		 136 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.890317  normal  0.840659 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02774  hypothetical protein  29.57 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0943  hypothetical protein  25.45 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2255  hypothetical protein  40.35 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.165293  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>