43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0943 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0943  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1054  hypothetical protein  67.13 
 
 
142 aa  188  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2439  hypothetical protein  43.22 
 
 
135 aa  97.1  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1353  hypothetical protein  36.13 
 
 
133 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0247445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2326  hypothetical protein  45.97 
 
 
129 aa  84.7  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306612  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0462  hypothetical protein  37.17 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0091  hypothetical protein  34.21 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2028  hypothetical protein  36.28 
 
 
133 aa  80.1  0.00000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4836  membrane-like protein  36.52 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0351  hypothetical protein  36.29 
 
 
136 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3588  hypothetical protein  40.34 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0899  putative transmembrane protein  33.04 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2255  hypothetical protein  39 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.165293  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1178  membrane protein-like protein  33.91 
 
 
138 aa  68.2  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2251  hypothetical protein  35.65 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3355  hypothetical protein  34.78 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1552  hypothetical protein  35.51 
 
 
136 aa  66.6  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.890317  normal  0.840659 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0731  hypothetical protein  36 
 
 
136 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356559  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1340  hypothetical protein  27.68 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3568  hypothetical protein  39.62 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0969  hypothetical protein  35.09 
 
 
133 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.7704  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4918  hypothetical protein  34.31 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.484884 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1193  hypothetical protein  40.35 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0742  hypothetical protein  36 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1594  hypothetical protein  33.05 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3784  hypothetical protein  29.82 
 
 
133 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637465  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3561  hypothetical protein  41.49 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3097  hypothetical protein  35.04 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23708  normal  0.0273238 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3216  hypothetical protein  30.97 
 
 
135 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488544  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0388  hypothetical protein  33.33 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.965904  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2042  hypothetical protein  35.59 
 
 
134 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1122  hypothetical protein  31.58 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0934652 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1447  hypothetical protein  31.58 
 
 
129 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2365  hypothetical protein  35.04 
 
 
132 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.841985  normal  0.667316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2028  membrane protein-like protein  31.58 
 
 
138 aa  52.8  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02774  hypothetical protein  29.63 
 
 
145 aa  49.3  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0848  membrane protein-like protein  29.52 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0261  hypothetical protein  32.48 
 
 
137 aa  47  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0266  hypothetical protein  31.62 
 
 
137 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0130  hypothetical protein  25.66 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4085  hypothetical protein  28.32 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0763  hypothetical protein  29.13 
 
 
133 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0276649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2331  hypothetical protein  29.57 
 
 
138 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0417022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>