43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3355 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_3355  hypothetical protein  100 
 
 		 159 aa  318  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3588  hypothetical protein  73.48 
 
 		 132 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4918  hypothetical protein  62.88 
 
 		 133 aa  176  9e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.484884 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2365  hypothetical protein  68.94 
 
 		 132 aa  173  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.841985  normal  0.667316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3097  hypothetical protein  66.67 
 
 		 132 aa  168  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23708  normal  0.0273238 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2251  hypothetical protein  51.35 
 
 		 135 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3216  hypothetical protein  52.29 
 
 		 135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0899  putative transmembrane protein  43.2 
 
 		 143 aa  95.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0091  hypothetical protein  38.46 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1353  hypothetical protein  38.35 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247445 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2028  hypothetical protein  37.4 
 
 		 133 aa  85.5  3e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0848  membrane protein-like protein  36.92 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4836  membrane-like protein  37.69 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0462  hypothetical protein  34.33 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2439  hypothetical protein  38.52 
 
 		 135 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2042  hypothetical protein  36.75 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0388  hypothetical protein  35.9 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.965904  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1340  hypothetical protein  34.26 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3561  hypothetical protein  46.39 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0351  hypothetical protein  32.54 
 
 		 136 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3568  hypothetical protein  37.61 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1447  hypothetical protein  35.77 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2326  hypothetical protein  34.21 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306612  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1552  hypothetical protein  35.45 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.890317  normal  0.840659 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0943  hypothetical protein  39.56 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1594  hypothetical protein  32.28 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0969  hypothetical protein  33.08 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.7704  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0130  hypothetical protein  28.33 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0731  hypothetical protein  29.85 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3784  hypothetical protein  33.07 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637465  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1122  hypothetical protein  31.5 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0934652 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0742  hypothetical protein  27.82 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1178  membrane protein-like protein  28.33 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2255  hypothetical protein  30.93 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.165293  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1054  hypothetical protein  36.21 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2028  membrane protein-like protein  31.01 
 
 		 138 aa  51.6  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02774  hypothetical protein  32.5 
 
 		 145 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1193  hypothetical protein  36.8 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2331  hypothetical protein  28.57 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0417022  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0261  hypothetical protein  31.2 
 
 		 137 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0266  hypothetical protein  30.4 
 
 		 137 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0689  hypothetical protein  29.2 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0763  hypothetical protein  27.27 
 
 		 133 aa  43.9  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0276649  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>