42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2331 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2331  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  263  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0417022  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0130  hypothetical protein  58.21 
 
 		 138 aa  140  7e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0899  putative transmembrane protein  46.46 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_002936  DET0763  hypothetical protein  40.68 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0276649  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0689  hypothetical protein  39.67 
 
 		 133 aa  84  7e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0091  hypothetical protein  37.69 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_669  hypothetical protein  39.13 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.209076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2439  hypothetical protein  40.32 
 
 		 135 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2326  hypothetical protein  41.6 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306612  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0462  hypothetical protein  33.87 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1353  hypothetical protein  32.26 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247445 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1193  hypothetical protein  39.47 
 
 		 135 aa  66.6  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1594  hypothetical protein  40.94 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0261  hypothetical protein  32.26 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0266  hypothetical protein  31.45 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0969  hypothetical protein  37.3 
 
 		 133 aa  64.7  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.7704  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4836  membrane-like protein  32.28 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3784  hypothetical protein  39.37 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637465  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0351  hypothetical protein  34.65 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1447  hypothetical protein  39.23 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2251  hypothetical protein  37.29 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1122  hypothetical protein  35.71 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0934652 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0742  hypothetical protein  34.92 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3588  hypothetical protein  32.56 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2028  membrane protein-like protein  34.68 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1178  membrane protein-like protein  30.08 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3355  hypothetical protein  30.6 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0731  hypothetical protein  32.81 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356559  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2028  hypothetical protein  33.64 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1340  hypothetical protein  32.46 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0848  membrane protein-like protein  33.63 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4918  hypothetical protein  28.57 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.484884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3216  hypothetical protein  31.9 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2042  hypothetical protein  33.62 
 
 		 134 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0388  hypothetical protein  33.62 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.965904  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02774  hypothetical protein  31.4 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2255  hypothetical protein  36.79 
 
 		 132 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.165293  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3561  hypothetical protein  36.27 
 
 		 134 aa  44.3  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4085  hypothetical protein  29.92 
 
 		 131 aa  42  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1552  hypothetical protein  30.71 
 
 		 136 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.890317  normal  0.840659 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3568  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0943  hypothetical protein  32.29 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>