43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4836 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4836  membrane-like protein  100 
 
 		 135 aa  262  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1552  hypothetical protein  59.82 
 
 		 136 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.890317  normal  0.840659 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2028  hypothetical protein  47.66 
 
 		 133 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1447  hypothetical protein  45.38 
 
 		 129 aa  114  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0091  hypothetical protein  45.74 
 
 		 133 aa  113  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0899  putative transmembrane protein  44.88 
 
 		 143 aa  110  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3784  hypothetical protein  47.33 
 
 		 133 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637465  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2326  hypothetical protein  42.4 
 
 		 129 aa  107  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306612  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1594  hypothetical protein  45.04 
 
 		 134 aa  105  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0462  hypothetical protein  40.98 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2255  hypothetical protein  52 
 
 		 132 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.165293  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0969  hypothetical protein  41.98 
 
 		 133 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.7704  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2439  hypothetical protein  43.8 
 
 		 135 aa  99.8  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1353  hypothetical protein  40 
 
 		 133 aa  95.9  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4918  hypothetical protein  40.6 
 
 		 133 aa  94  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.484884 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3216  hypothetical protein  47.57 
 
 		 135 aa  91.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.488544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0351  hypothetical protein  42.19 
 
 		 136 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3588  hypothetical protein  39.06 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2251  hypothetical protein  41.59 
 
 		 135 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1122  hypothetical protein  40.77 
 
 		 133 aa  88.2  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0934652 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1340  hypothetical protein  36.36 
 
 		 120 aa  86.7  9e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0388  hypothetical protein  42.24 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.965904  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2042  hypothetical protein  42.24 
 
 		 134 aa  84  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3561  hypothetical protein  56.7 
 
 		 134 aa  83.2  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2028  membrane protein-like protein  41.54 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0848  membrane protein-like protein  39.17 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1178  membrane protein-like protein  39.82 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3568  hypothetical protein  47.12 
 
 		 139 aa  79.7  0.00000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3355  hypothetical protein  37.69 
 
 		 159 aa  79.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1054  hypothetical protein  37.27 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0731  hypothetical protein  37.84 
 
 		 136 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0742  hypothetical protein  35.83 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2365  hypothetical protein  38.52 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.841985  normal  0.667316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3097  hypothetical protein  37.04 
 
 		 132 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23708  normal  0.0273238 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0943  hypothetical protein  34.69 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4085  hypothetical protein  33.85 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1193  hypothetical protein  37.5 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0763  hypothetical protein  33.04 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0276649  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0689  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_669  hypothetical protein  40.23 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.209076  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2331  hypothetical protein  37.04 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0417022  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02774  hypothetical protein  28.68 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0130  hypothetical protein  33.05 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>