41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02774 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02774  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  290  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1594  hypothetical protein  33.08 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4085  hypothetical protein  40 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3784  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.637465  normal  0.0246266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0899  putative transmembrane protein  36.89 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162831 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0091  hypothetical protein  40.35 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1447  hypothetical protein  34.59 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0261  hypothetical protein  35.9 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1353  hypothetical protein  36.07 
 
 		 133 aa  60.1  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0247445 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0266  hypothetical protein  35.9 
 
 		 137 aa  60.1  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0731  hypothetical protein  33.06 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0689  hypothetical protein  30.83 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2439  hypothetical protein  30.7 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0742  hypothetical protein  33.06 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0969  hypothetical protein  34.13 
 
 		 133 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.7704  normal  0.563021 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0388  hypothetical protein  30.25 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.965904  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3588  hypothetical protein  34.71 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2042  hypothetical protein  30.25 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0462  hypothetical protein  34.4 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1193  hypothetical protein  35.4 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2028  hypothetical protein  33.9 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_669  hypothetical protein  30.43 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.209076  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0763  hypothetical protein  29.06 
 
 		 133 aa  53.5  0.0000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0276649  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0351  hypothetical protein  34.75 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0848  membrane protein-like protein  30.56 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4836  membrane-like protein  28.68 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 132 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.165293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4918  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.484884 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1340  hypothetical protein  33.03 
 
 		 120 aa  51.6  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.203581  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1122  hypothetical protein  32.26 
 
 		 133 aa  51.2  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0934652 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2326  hypothetical protein  30.47 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.306612  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3355  hypothetical protein  32.5 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.394527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1552  hypothetical protein  31.3 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.890317  normal  0.840659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2251  hypothetical protein  31.58 
 
 		 135 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1178  membrane protein-like protein  27.59 
 
 		 138 aa  44.7  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1054  hypothetical protein  25.81 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3097  hypothetical protein  35 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.23708  normal  0.0273238 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2028  membrane protein-like protein  24.41 
 
 		 138 aa  41.6  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.711582  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0943  hypothetical protein  28.28 
 
 		 143 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0130  hypothetical protein  29.2 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3561  hypothetical protein  32.98 
 
 		 134 aa  40  0.01  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>