More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_1118 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009524  PsycPRwf_1118  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  257  4e-68  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1492  integrase catalytic subunit  99.19 
 
 		 242 aa  254  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1472  integrase catalytic subunit  99.19 
 
 		 242 aa  254  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.773509  normal  0.0414542 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1944  integrase catalytic subunit  99.19 
 
 		 242 aa  254  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1504  integrase catalytic subunit  99.19 
 
 		 242 aa  254  2e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1289  Integrase catalytic region  57.72 
 
 		 270 aa  152  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1236  Integrase catalytic region  57.72 
 
 		 270 aa  152  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2192  Integrase catalytic region  57.72 
 
 		 270 aa  152  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  56.91 
 
 		 262 aa  152  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4320  integrase catalytic subunit  53.66 
 
 		 264 aa  150  7e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  56.91 
 
 		 262 aa  149  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  56.91 
 
 		 262 aa  149  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  56.91 
 
 		 262 aa  149  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  56.91 
 
 		 262 aa  149  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  56.91 
 
 		 262 aa  149  1e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2602  integrase catalytic subunit  56.1 
 
 		 282 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.323138 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1971  hypothetical protein  55.28 
 
 		 270 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0800  hypothetical protein  51.22 
 
 		 281 aa  141  3e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3342  hypothetical protein  56.45 
 
 		 254 aa  140  4e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1079  hypothetical protein  50.41 
 
 		 281 aa  138  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  53.66 
 
 		 273 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  53.66 
 
 		 273 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  53.66 
 
 		 273 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  53.66 
 
 		 273 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  53.66 
 
 		 273 aa  135  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3953  integrase catalytic subunit  55.2 
 
 		 265 aa  133  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4053  integrase catalytic subunit  55.2 
 
 		 265 aa  133  6.0000000000000005e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0400  integrase catalytic subunit  54.4 
 
 		 265 aa  132  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4025  integrase catalytic subunit  51.2 
 
 		 266 aa  130  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3442  integrase catalytic subunit  48.8 
 
 		 266 aa  125  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1801  hypothetical protein  50 
 
 		 282 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3762  ISxcd1 transposase  48 
 
 		 192 aa  124  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0638  integrase catalytic subunit  48 
 
 		 272 aa  123  7e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1778  transposase OrfB  49.6 
 
 		 288 aa  120  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  49.59 
 
 		 370 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  49.59 
 
 		 370 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  49.59 
 
 		 370 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  49.59 
 
 		 370 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  49.59 
 
 		 370 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  49.59 
 
 		 370 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  49.59 
 
 		 370 aa  120  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3451  integrase catalytic subunit  48.8 
 
 		 248 aa  120  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 		 362 aa  120  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 		 362 aa  120  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  48 
 
 		 362 aa  120  6e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0637  transposase OrfB  48.8 
 
 		 249 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.417638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0640  transposase OrfB  48.8 
 
 		 249 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.263209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0849  transposase OrfB  48.8 
 
 		 249 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0618  ISxcd1 transposase  46.4 
 
 		 266 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3364  ISxcd1 transposase  46.4 
 
 		 266 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2857  integrase catalytic subunit  48.8 
 
 		 275 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000284719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3960  integrase catalytic subunit  48.8 
 
 		 275 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02902  Integrase, catalytic region  47.5 
 
 		 267 aa  118  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0965  ISSod2, transposase OrfB  46.03 
 
 		 271 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2160  ISSod2, transposase OrfB  46.03 
 
 		 271 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4269  ISSod2, transposase OrfB  46.03 
 
 		 271 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0823  ISMca4, transposase, OrfAB  46.4 
 
 		 362 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1620  ISMca4, transposase, OrfAB  46.4 
 
 		 362 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2689  prophage LambdaMc01, ISMca4, transposase, OrfAB  46.4 
 
 		 362 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0539833  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4808  transposase B  61.84 
 
 		 207 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3068  transposase B  61.84 
 
 		 207 aa  107  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1138  Integrase catalytic region  49.59 
 
 		 273 aa  105  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0377026  hitchhiker  0.000000017757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2897  ISxcd1 transposase  52.27 
 
 		 209 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  38.21 
 
 		 282 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  37.4 
 
 		 282 aa  97.4  6e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0089  putative transposase  47.47 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.532302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3784  integrase catalytic subunit  41.46 
 
 		 270 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  40.65 
 
 		 274 aa  93.6  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  36.29 
 
 		 280 aa  84.3  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2425  integrase catalytic subunit  30.65 
 
 		 276 aa  84  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.043442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1302  putative transposase  32.23 
 
 		 173 aa  84  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.607865  normal  0.107651 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  31.09 
 
 		 264 aa  82  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  32.52 
 
 		 279 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  33.06 
 
 		 280 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7691  integrase catalytic subunit  33.61 
 
 		 312 aa  82  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0787  hypothetical protein  31.93 
 
 		 206 aa  81.3  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  29.75 
 
 		 260 aa  81.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3925  integrase catalytic region  36.29 
 
 		 251 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00155278  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0094  integrase core subunit  37.6 
 
 		 269 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.445692 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0806  hypothetical protein  32.48 
 
 		 267 aa  80.9  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4215  ISxcd1 transposase  46.81 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0067  integrase catalytic region  37.3 
 
 		 251 aa  80.9  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05623  transposase  38.76 
 
 		 305 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1303  transposase  38.76 
 
 		 305 aa  80.5  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3393  integrase catalytic subunit  31.93 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0133  transposase B  35.77 
 
 		 269 aa  79.7  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.809419  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0298  IS407A, transposase OrfB  31.45 
 
 		 277 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000127276  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0167  IS407A, transposase OrfB  31.45 
 
 		 277 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000489876  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1523  A, transposase OrfB  31.45 
 
 		 165 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  31.36 
 
 		 273 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  31.36 
 
 		 273 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  31.36 
 
 		 273 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  31.36 
 
 		 273 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  31.36 
 
 		 273 aa  77  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3877  A, transposase OrfB  31.45 
 
 		 277 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  30.58 
 
 		 372 aa  77  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  30.58 
 
 		 372 aa  77  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  30.58 
 
 		 372 aa  77  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  30.58 
 
 		 372 aa  77  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  30.58 
 
 		 372 aa  77  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>