More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_B0089 on replicon NC_010157
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010157  YpAngola_B0089  putative transposase  100 
 
 		 126 aa  259  8.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.532302 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4320  integrase catalytic subunit  69.11 
 
 		 264 aa  177  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4808  transposase B  70.59 
 
 		 207 aa  149  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1079  hypothetical protein  59.5 
 
 		 281 aa  148  2e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3068  transposase B  69.61 
 
 		 207 aa  147  5e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2602  integrase catalytic subunit  57.72 
 
 		 282 aa  146  7e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.323138 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2192  Integrase catalytic region  56.91 
 
 		 270 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1236  Integrase catalytic region  56.91 
 
 		 270 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1289  Integrase catalytic region  56.91 
 
 		 270 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0800  hypothetical protein  58.68 
 
 		 281 aa  144  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1971  hypothetical protein  58.68 
 
 		 270 aa  144  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1262  Integrase catalytic region  57.38 
 
 		 262 aa  142  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.632188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2354  Integrase catalytic region  56.56 
 
 		 262 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0944  Integrase catalytic region  56.56 
 
 		 262 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0274  Integrase catalytic region  56.56 
 
 		 262 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0432  Integrase catalytic region  56.56 
 
 		 262 aa  139  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2229  Integrase catalytic region  55.74 
 
 		 262 aa  137  7e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1138  Integrase catalytic region  59.02 
 
 		 273 aa  120  8e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0377026  hitchhiker  0.000000017757 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0526  Integrase catalytic region  50.83 
 
 		 273 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.881948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0882  Integrase catalytic region  50.83 
 
 		 273 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00798706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2314  Integrase catalytic region  50.83 
 
 		 273 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3123  Integrase catalytic region  50.83 
 
 		 273 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.266694 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1935  Integrase catalytic region  50.83 
 
 		 273 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  49.58 
 
 		 370 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  49.58 
 
 		 370 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  49.58 
 
 		 370 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  49.58 
 
 		 370 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  49.58 
 
 		 370 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  49.58 
 
 		 370 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  49.58 
 
 		 370 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3342  hypothetical protein  43.44 
 
 		 254 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1944  integrase catalytic subunit  46.72 
 
 		 242 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1504  integrase catalytic subunit  46.72 
 
 		 242 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1492  integrase catalytic subunit  46.72 
 
 		 242 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275235 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1472  integrase catalytic subunit  46.72 
 
 		 242 aa  114  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.773509  normal  0.0414542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02902  Integrase, catalytic region  45.08 
 
 		 267 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1778  transposase OrfB  50 
 
 		 288 aa  101  3e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2897  ISxcd1 transposase  49.02 
 
 		 209 aa  100  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0637  transposase OrfB  49.57 
 
 		 249 aa  100  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.417638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0640  transposase OrfB  49.57 
 
 		 249 aa  100  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.263209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0849  transposase OrfB  49.57 
 
 		 249 aa  100  8e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.553346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0618  ISxcd1 transposase  48.51 
 
 		 266 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3364  ISxcd1 transposase  48.51 
 
 		 266 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4025  integrase catalytic subunit  49.57 
 
 		 266 aa  99.8  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2857  integrase catalytic subunit  51.49 
 
 		 275 aa  98.6  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000284719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3960  integrase catalytic subunit  51.49 
 
 		 275 aa  98.6  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1801  hypothetical protein  47.86 
 
 		 282 aa  98.2  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0638  integrase catalytic subunit  41.8 
 
 		 272 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3451  integrase catalytic subunit  50.5 
 
 		 248 aa  97.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3762  ISxcd1 transposase  46.96 
 
 		 192 aa  97.1  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3953  integrase catalytic subunit  45.97 
 
 		 265 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4053  integrase catalytic subunit  45.97 
 
 		 265 aa  97.1  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0965  ISSod2, transposase OrfB  41.94 
 
 		 271 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2160  ISSod2, transposase OrfB  41.94 
 
 		 271 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4269  ISSod2, transposase OrfB  41.94 
 
 		 271 aa  96.3  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3442  integrase catalytic subunit  47.83 
 
 		 266 aa  96.3  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.702285 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1118  hypothetical protein  47.47 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0400  integrase catalytic subunit  45.16 
 
 		 265 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3784  integrase catalytic subunit  40.68 
 
 		 270 aa  88.6  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  44.35 
 
 		 362 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  44.35 
 
 		 362 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  44.35 
 
 		 362 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0823  ISMca4, transposase, OrfAB  40 
 
 		 362 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1620  ISMca4, transposase, OrfAB  40 
 
 		 362 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2689  prophage LambdaMc01, ISMca4, transposase, OrfAB  40 
 
 		 362 aa  81.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0539833  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0376  integrase catalytic region  38.14 
 
 		 274 aa  79.7  0.00000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000146675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4852  integrase catalytic region  37.93 
 
 		 260 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0318827 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4005  integrase catalytic region  36.75 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.5936 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4597  Integrase catalytic region  37.29 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  35.59 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  35.59 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  35.59 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  35.59 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  35.59 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  35.59 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  35.59 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  35.59 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  35.59 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0024  integrase core domain protein  36.44 
 
 		 276 aa  72  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.73785  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  35.59 
 
 		 372 aa  72.4  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2968  integrase catalytic subunit  34.75 
 
 		 264 aa  71.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.166186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0607  integrase catalytic region  39.83 
 
 		 233 aa  71.6  0.000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0876  integrase catalytic region  33.9 
 
 		 273 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1913  putative insertion element  33.9 
 
 		 273 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000339403 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0464  integrase catalytic region  33.9 
 
 		 273 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2508  integrase  33.9 
 
 		 273 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0298999 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2104  putative integrase  33.9 
 
 		 273 aa  71.6  0.000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.209867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03932  ISXoo3 transposase ORF B  33.06 
 
 		 281 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4336  integrase catalytic region  37.29 
 
 		 309 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.139423  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4683  integrase catalytic region  37.29 
 
 		 309 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4529  integrase catalytic region  37.29 
 
 		 309 aa  70.5  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  32.26 
 
 		 281 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  32.26 
 
 		 281 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02391  ISXoo3 transposase ORF B  32.26 
 
 		 281 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.555401  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1567  Integrase catalytic region  36.44 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4089  integrase catalytic region  35.59 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.805064  normal  0.114736 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0404  integrase catalytic region  35.59 
 
 		 269 aa  69.3  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.980653 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3357  integrase catalytic region  35.59 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2509  integrase  35.59 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0263754 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  32.26 
 
 		 281 aa  69.3  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>