113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2978 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2978  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2777  acyl carrier protein, putative  96.3 
 
 		 189 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0424  hypothetical protein  26.72 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0400  hypothetical protein  27.59 
 
 		 137 aa  56.2  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2666  acyl carrier protein  32.05 
 
 		 78 aa  50.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000112486  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2352  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 79 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3819  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 79 aa  50.4  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.542696  normal  0.0672791 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3122  phosphopantetheine-binding protein  30.77 
 
 		 128 aa  50.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.172953  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1627  acyl carrier protein  30.38 
 
 		 77 aa  49.7  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0810267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1767  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 78 aa  50.1  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0300385  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1768  acyl carrier protein  36.76 
 
 		 77 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.461775 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 80 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1157  acyl carrier protein  32 
 
 		 78 aa  50.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000000567099  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2018  Acyl carrier protein (ACP)  37.5 
 
 		 78 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000498687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1687  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 79 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2463  acyl carrier protein  35.82 
 
 		 77 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2468  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 79 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2301  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 79 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0385608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2978  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 79 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.702686  normal  0.101064 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1125  acyl carrier protein  35.82 
 
 		 77 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.854343  normal  0.264309 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1070  acyl carrier protein  35.82 
 
 		 77 aa  49.7  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0381067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3132  acyl carrier protein  32.05 
 
 		 78 aa  49.3  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3483  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 79 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.057924  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1052  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 77 aa  48.9  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.784582  normal  0.0871909 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0269  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 81 aa  48.9  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00107759  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0267  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 81 aa  48.9  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0366533  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0459  acyl carrier protein  36.23 
 
 		 78 aa  48.5  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.997029  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0464  acyl carrier protein  36.23 
 
 		 78 aa  48.5  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0572  acyl carrier protein  36.23 
 
 		 78 aa  48.5  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000726263  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0417  acyl carrier protein  32.89 
 
 		 77 aa  48.1  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0452  acyl carrier protein  43.64 
 
 		 88 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1291  acyl carrier protein  35.21 
 
 		 77 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1316  acyl carrier protein  35.21 
 
 		 77 aa  47.8  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0746  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 78 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.746533  normal  0.50277 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1058  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 78 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0713713 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0685  acyl carrier protein  31.94 
 
 		 75 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00698969  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1201  acyl carrier protein  34.72 
 
 		 78 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.576937  hitchhiker  0.00368899 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0798  acyl carrier protein  33.8 
 
 		 77 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0280  acyl carrier protein  32.43 
 
 		 78 aa  47  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2725  phosphopantetheine-binding protein  28.95 
 
 		 101 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1075  acyl carrier protein  39.29 
 
 		 78 aa  46.2  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690942  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1339  acyl carrier protein  30.99 
 
 		 78 aa  46.2  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.52176  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  30.38 
 
 		 79 aa  46.2  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0088  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 78 aa  46.2  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2565  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 78 aa  46.2  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  32 
 
 		 80 aa  45.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  29.87 
 
 		 82 aa  45.8  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2181  acyl carrier protein  30.67 
 
 		 77 aa  45.4  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  29.49 
 
 		 80 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  30.67 
 
 		 80 aa  45.4  0.0005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0498  acyl carrier protein  33.75 
 
 		 78 aa  45.4  0.0005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  29.49 
 
 		 80 aa  45.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0933  acyl carrier protein  30.56 
 
 		 74 aa  45.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000201436  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  32.88 
 
 		 74 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1530  acyl carrier protein  38.6 
 
 		 78 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129893  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17331  acyl carrier protein (ACP)  32 
 
 		 80 aa  45.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0558  acyl carrier protein  29.49 
 
 		 78 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.531759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3198  acyl carrier protein  28.21 
 
 		 78 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0370442 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0529  acyl carrier protein  29.49 
 
 		 78 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.221714 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1584  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 82 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.34262  normal  0.0373148 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0493  acyl carrier protein  29.49 
 
 		 78 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.548895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1909  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 82 aa  45.1  0.0006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.045523  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2785  acyl carrier protein  28.21 
 
 		 78 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  37.5 
 
 		 79 aa  45.1  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  29.49 
 
 		 78 aa  44.7  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18181  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 79 aa  44.7  0.0009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.180905  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18011  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 79 aa  44.7  0.0009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1382  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 81 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0180925  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3755  acyl carrier protein  30 
 
 		 99 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.345144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17961  acyl carrier protein  33.33 
 
 		 80 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0258441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  30.56 
 
 		 75 aa  44.3  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0408  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 79 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.442287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0713  acyl carrier protein  28.95 
 
 		 78 aa  43.1  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000031745  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1320  acyl carrier protein  36.17 
 
 		 94 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3122  phosphopantetheine-binding protein  30.26 
 
 		 101 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.884659  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26061  acyl carrier protein  29.33 
 
 		 103 aa  43.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2778  acyl carrier protein  30.26 
 
 		 99 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.961024 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0983  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 79 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415355  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1011  acyl carrier protein  34.78 
 
 		 85 aa  43.1  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000303772  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0918  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 79 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.150298  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2117  acyl carrier protein  36.17 
 
 		 92 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.307838  hitchhiker  0.00250783 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  33.93 
 
 		 79 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2359  acyl carrier protein  36.17 
 
 		 105 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.701799  normal  0.0109662 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1053  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 79 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.549233 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 79 aa  42.7  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1548  Acyl carrier protein (ACP)  40.43 
 
 		 77 aa  42.7  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.079585  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1504  acyl carrier protein  41.67 
 
 		 78 aa  42.7  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0070299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  35.71 
 
 		 79 aa  42.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  38.89 
 
 		 81 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1873  acyl carrier protein  28 
 
 		 78 aa  42.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0107725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0131  hypothetical protein  24.36 
 
 		 81 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3380  acyl carrier protein  32 
 
 		 79 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0442067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1319  acyl carrier protein  27.85 
 
 		 78 aa  43.1  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.346066  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1701  acyl carrier protein  31.88 
 
 		 79 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3365  acyl carrier protein  28.75 
 
 		 97 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.257859  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3427  acyl carrier protein  28.75 
 
 		 97 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3376  acyl carrier protein  28.75 
 
 		 97 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0847  acyl carrier protein  32.14 
 
 		 93 aa  42.4  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4192  acyl carrier protein  26.92 
 
 		 78 aa  42.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.666871  normal  0.675617 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1898  acyl carrier protein  26.92 
 
 		 79 aa  42.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281225 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>