16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2663 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2663  hypothetical protein  100 
 
 		 269 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3016  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  97.77 
 
 		 277 aa  547  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  0.0985209 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2806  lipopolysaccharide core biosynthesis domain-containing protein  91.08 
 
 		 269 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2729  lipopolysaccharide core biosynthesis domain-containing protein  74.33 
 
 		 262 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.097522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2496  lipopolysaccharide core biosynthesis domain-containing protein  54.22 
 
 		 278 aa  287  1e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482991  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2767  lipopolysaccharide core biosynthesis domain protein  53.01 
 
 		 287 aa  281  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0159564  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3995  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.45 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3914  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.45 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276717  normal  0.0204062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3933  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.45 
 
 		 269 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4040  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  28.45 
 
 		 269 aa  93.6  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4828  putative lipopolysaccharide glycosyltransferase  27.08 
 
 		 300 aa  89  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0588871  hitchhiker  0.000203117 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0081  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.94 
 
 		 283 aa  88.6  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3151  putative lipopolysaccharide glycosyltransferase  27.73 
 
 		 302 aa  85.5  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1180  hypothetical protein  29.7 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0801298  hitchhiker  0.00212296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4766  hypothetical protein  27.96 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2831  hypothetical protein  22.03 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000150593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>