14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0081 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0081  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  100 
 
 		 283 aa  576  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3995  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  70.61 
 
 		 269 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4040  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  70.23 
 
 		 269 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3914  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  70.61 
 
 		 269 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276717  normal  0.0204062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3933  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  70.61 
 
 		 269 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3016  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  26.94 
 
 		 277 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  0.0985209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2663  hypothetical protein  26.94 
 
 		 269 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2806  lipopolysaccharide core biosynthesis domain-containing protein  28.46 
 
 		 269 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2729  lipopolysaccharide core biosynthesis domain-containing protein  26.34 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.097522 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2767  lipopolysaccharide core biosynthesis domain protein  23.36 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0159564  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2496  lipopolysaccharide core biosynthesis domain-containing protein  23.75 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4828  putative lipopolysaccharide glycosyltransferase  23.43 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0588871  hitchhiker  0.000203117 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1180  hypothetical protein  25.43 
 
 		 280 aa  43.1  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0801298  hitchhiker  0.00212296 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3151  putative lipopolysaccharide glycosyltransferase  22.86 
 
 		 302 aa  42.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>