16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2729 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2729  lipopolysaccharide core biosynthesis domain-containing protein  100 
 
 		 262 aa  541  1e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.097522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2806  lipopolysaccharide core biosynthesis domain-containing protein  77.01 
 
 		 269 aa  427  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3016  lipopolysaccharide core biosynthesis protein, putative  75.1 
 
 		 277 aa  412  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.567321  normal  0.0985209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2663  hypothetical protein  74.33 
 
 		 269 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2496  lipopolysaccharide core biosynthesis domain-containing protein  52.44 
 
 		 278 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482991  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2767  lipopolysaccharide core biosynthesis domain protein  52.87 
 
 		 287 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0159564  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3995  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  30.51 
 
 		 269 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3914  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  30.51 
 
 		 269 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.276717  normal  0.0204062 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3933  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  30.51 
 
 		 269 aa  88.6  8e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4040  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  30.51 
 
 		 269 aa  88.6  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3151  putative lipopolysaccharide glycosyltransferase  26.12 
 
 		 302 aa  84.7  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4828  putative lipopolysaccharide glycosyltransferase  27.8 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0588871  hitchhiker  0.000203117 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0081  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  26.34 
 
 		 283 aa  82  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1180  hypothetical protein  27.59 
 
 		 280 aa  69.3  0.00000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0801298  hitchhiker  0.00212296 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4766  hypothetical protein  56.76 
 
 		 285 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3737  hypothetical protein  27.12 
 
 		 349 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>