120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2698 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2698  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26450  hypothetical protein  80.85 
 
 		 189 aa  307  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0067592  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3755  hypothetical protein  77.13 
 
 		 190 aa  286  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1725  hypothetical protein  76.7 
 
 		 178 aa  266  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.113656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6717  protein of unknown function DUF204  68.28 
 
 		 189 aa  256  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3977  protein of unknown function DUF204  67.37 
 
 		 191 aa  238  5e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.164698 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4397  hypothetical protein  62.96 
 
 		 232 aa  233  1.0000000000000001e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2817  hypothetical protein  60 
 
 		 189 aa  228  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2025  protein of unknown function DUF204  60.22 
 
 		 190 aa  225  2e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.331767  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02753  membrane protein YebN  60.42 
 
 		 232 aa  223  1e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1979  protein of unknown function DUF204  59.14 
 
 		 190 aa  223  1e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0850567  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01791  conserved inner membrane protein  56.99 
 
 		 188 aa  222  3e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000275472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1822  protein of unknown function DUF204  56.99 
 
 		 188 aa  222  3e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1911  hypothetical protein  56.99 
 
 		 188 aa  222  3e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2050  hypothetical protein  56.99 
 
 		 188 aa  222  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1811  hypothetical protein  56.99 
 
 		 188 aa  222  3e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035153  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1366  hypothetical protein  56.99 
 
 		 188 aa  222  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000222622  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2088  hypothetical protein  56.99 
 
 		 188 aa  222  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2553  hypothetical protein  56.99 
 
 		 188 aa  222  3e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000161529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01779  hypothetical protein  56.99 
 
 		 188 aa  222  3e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1922  hypothetical protein  59.14 
 
 		 190 aa  221  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0107711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2372  hypothetical protein  62.7 
 
 		 189 aa  220  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000118461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1655  hypothetical protein  62.7 
 
 		 189 aa  220  8e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000365012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2468  hypothetical protein  62.7 
 
 		 189 aa  220  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00922383  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2215  protein of unknown function DUF204  59.14 
 
 		 190 aa  216  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000652284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2035  membrane protein YebN  56.45 
 
 		 188 aa  214  8e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1974  membrane protein YebN  56.45 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  0.466937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1978  membrane protein YebN  56.45 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1297  membrane protein YebN  56.45 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00128571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1481  membrane protein YebN  56.45 
 
 		 188 aa  213  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0169  hypothetical protein  57.89 
 
 		 196 aa  200  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0582561  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2390  hypothetical protein  58.93 
 
 		 200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7389  hypothetical protein  51.34 
 
 		 185 aa  184  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4096  hypothetical protein  48.94 
 
 		 188 aa  180  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1363  hypothetical protein  56.76 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1452  hypothetical protein  57.59 
 
 		 194 aa  164  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.960759  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1382  hypothetical protein  57.07 
 
 		 194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.321925  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02440  predicted membrane protein  44.13 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1420  hypothetical protein  42.16 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000356412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2187  protein of unknown function DUF204  37.84 
 
 		 189 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480429 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2300  protein of unknown function DUF204  43.24 
 
 		 186 aa  138  6e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168239  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1637  hypothetical protein  40.54 
 
 		 190 aa  137  1e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000104558  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0455  hypothetical protein  39.78 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2102  protein of unknown function DUF204  44.32 
 
 		 187 aa  134  5e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1412  protein of unknown function DUF204  36.22 
 
 		 189 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000313106  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1192  hypothetical protein  40.34 
 
 		 194 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0282  hypothetical protein  45.08 
 
 		 193 aa  127  7.000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0273862  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2453  protein of unknown function DUF204  36.22 
 
 		 187 aa  127  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3656  protein of unknown function DUF204  36.22 
 
 		 187 aa  127  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00251893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2070  hypothetical protein  40.12 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000608383  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1700  protein of unknown function DUF204  43.24 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000050274  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1699  protein of unknown function DUF204  38.95 
 
 		 193 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2039  hypothetical protein  38.92 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4533  hypothetical protein  44.39 
 
 		 188 aa  124  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0109117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2522  protein of unknown function DUF204  41.89 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0555852 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0162  hypothetical protein  38.92 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0202  hypothetical protein  38.92 
 
 		 187 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0516  hypothetical protein  36.76 
 
 		 213 aa  120  9e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1725  membrane protein  34.05 
 
 		 181 aa  120  9.999999999999999e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0559  protein of unknown function DUF204  37.99 
 
 		 179 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.179338  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0503  hypothetical protein  36.27 
 
 		 213 aa  118  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0180  hypothetical protein  38.38 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2322  protein of unknown function DUF204  38.5 
 
 		 186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0412  hypothetical protein  39.11 
 
 		 184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1799  protein of unknown function DUF204  38.38 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.971603 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3406  protein of unknown function DUF204  40.11 
 
 		 190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000037692  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1273  protein of unknown function DUF204  40.11 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1531  hypothetical protein  33.33 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000880885  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2978  hypothetical protein  38.18 
 
 		 190 aa  108  6e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0770545  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03700  predicted membrane protein  38.5 
 
 		 185 aa  107  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0724834  normal  0.0195872 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02600  predicted membrane protein  35.48 
 
 		 194 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000087208  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0168  hypothetical protein  35 
 
 		 192 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1654  membrane protein  32.77 
 
 		 182 aa  106  2e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0963  hypothetical protein  36.02 
 
 		 193 aa  104  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044765  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_952  hypothetical protein  36.02 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3146  hypothetical protein  34.64 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.120632  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1134  hypothetical protein  34.92 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000076644  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0006  hypothetical protein  35.6 
 
 		 195 aa  99.8  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000857448  hitchhiker  0.000000941545 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1107  protein of unknown function DUF204  30.11 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1449  protein of unknown function DUF204  35.56 
 
 		 189 aa  99.4  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.290539  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0090  membrane protein  36.07 
 
 		 184 aa  98.6  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0210402  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1800  cell division protein  30.77 
 
 		 185 aa  98.2  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145109  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0247  hypothetical protein  34.34 
 
 		 186 aa  97.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0431  hypothetical protein  32.79 
 
 		 182 aa  97.8  9e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0221  hypothetical protein  30.68 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0024  protein of unknown function DUF204  31.61 
 
 		 199 aa  95.1  5e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.992365 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1232  protein of unknown function DUF204  33.52 
 
 		 188 aa  95.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21610  predicted membrane protein  31.32 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.890881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3288  hypothetical protein  35.96 
 
 		 181 aa  90.5  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00723105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1326  hypothetical protein  30.05 
 
 		 185 aa  87  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0607  hypothetical protein  29.82 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.686733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4180  protein of unknown function DUF204  33.52 
 
 		 181 aa  84  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000492866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1339  hypothetical protein  32.53 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5447  hypothetical protein  30 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00491428  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0005  hypothetical protein  31.75 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.33307  hitchhiker  0.000135585 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2150  hypothetical protein  32.42 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5451  hypothetical protein  30.17 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5173  hypothetical protein  30.17 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124762  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5567  hypothetical protein  30.17 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000345667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5416  hypothetical protein  30.17 
 
 		 182 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>