121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2817 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_2817  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1922  hypothetical protein  78.95 
 
 
190 aa  304  5.0000000000000004e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0107711  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2215  protein of unknown function DUF204  76.84 
 
 
190 aa  296  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000652284  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1979  protein of unknown function DUF204  76.32 
 
 
190 aa  294  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0850567  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2025  protein of unknown function DUF204  76.84 
 
 
190 aa  293  8e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.331767  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2372  hypothetical protein  82.7 
 
 
189 aa  291  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000118461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1655  hypothetical protein  82.7 
 
 
189 aa  291  3e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000365012  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2468  hypothetical protein  82.7 
 
 
189 aa  291  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00922383  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1974  membrane protein YebN  73.66 
 
 
188 aa  280  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  0.466937 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2035  membrane protein YebN  73.66 
 
 
188 aa  280  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1978  membrane protein YebN  73.66 
 
 
188 aa  280  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1297  membrane protein YebN  73.66 
 
 
188 aa  280  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00128571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1481  membrane protein YebN  73.66 
 
 
188 aa  280  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01791  conserved inner membrane protein  72.04 
 
 
188 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000275472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1822  protein of unknown function DUF204  72.04 
 
 
188 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1911  hypothetical protein  72.04 
 
 
188 aa  276  2e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2050  hypothetical protein  72.04 
 
 
188 aa  276  2e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1811  hypothetical protein  72.04 
 
 
188 aa  276  2e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035153  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1366  hypothetical protein  72.04 
 
 
188 aa  276  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000222622  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2088  hypothetical protein  72.04 
 
 
188 aa  276  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2553  hypothetical protein  72.04 
 
 
188 aa  276  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000161529  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01779  hypothetical protein  72.04 
 
 
188 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2390  hypothetical protein  73.65 
 
 
200 aa  264  7e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0400913  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6717  protein of unknown function DUF204  60.54 
 
 
189 aa  227  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3755  hypothetical protein  59.14 
 
 
190 aa  226  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1725  hypothetical protein  61.49 
 
 
178 aa  224  6e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.113656  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26450  hypothetical protein  59.68 
 
 
189 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0067592  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2698  hypothetical protein  60 
 
 
188 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4397  hypothetical protein  58.6 
 
 
232 aa  215  2.9999999999999998e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02753  membrane protein YebN  52.88 
 
 
232 aa  192  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4096  hypothetical protein  50.54 
 
 
188 aa  189  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7389  hypothetical protein  54.05 
 
 
185 aa  187  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3977  protein of unknown function DUF204  54.5 
 
 
191 aa  180  1e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.164698 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1363  hypothetical protein  54.09 
 
 
189 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0169  hypothetical protein  49.74 
 
 
196 aa  156  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0582561  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1420  hypothetical protein  42.62 
 
 
198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000356412  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2187  protein of unknown function DUF204  40.64 
 
 
189 aa  138  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480429 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2300  protein of unknown function DUF204  43.85 
 
 
186 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168239  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02440  predicted membrane protein  40.96 
 
 
188 aa  136  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307428  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0455  hypothetical protein  38.71 
 
 
201 aa  135  4e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1637  hypothetical protein  38.62 
 
 
190 aa  135  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000104558  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2039  hypothetical protein  40.54 
 
 
185 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0282  hypothetical protein  43.98 
 
 
193 aa  131  5e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0273862  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3656  protein of unknown function DUF204  38.92 
 
 
187 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00251893  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2453  protein of unknown function DUF204  38.92 
 
 
187 aa  130  9e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1382  hypothetical protein  49.46 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.321925  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02600  predicted membrane protein  42.47 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000087208  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1452  hypothetical protein  49.46 
 
 
194 aa  125  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.960759  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1412  protein of unknown function DUF204  37.43 
 
 
189 aa  125  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000313106  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2102  protein of unknown function DUF204  41.94 
 
 
187 aa  124  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0162  hypothetical protein  40.11 
 
 
187 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0202  hypothetical protein  40.11 
 
 
187 aa  122  4e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0180  hypothetical protein  40.11 
 
 
187 aa  121  6e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0503  hypothetical protein  40.78 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1192  hypothetical protein  36.31 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0516  hypothetical protein  40.78 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0559  protein of unknown function DUF204  37.29 
 
 
179 aa  119  3e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.179338  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4533  hypothetical protein  41.4 
 
 
188 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0109117 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2322  protein of unknown function DUF204  38.5 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1273  protein of unknown function DUF204  39.27 
 
 
192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1799  protein of unknown function DUF204  39.78 
 
 
190 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.971603 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0168  hypothetical protein  37.22 
 
 
192 aa  111  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1699  protein of unknown function DUF204  35.57 
 
 
193 aa  111  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1725  membrane protein  34.46 
 
 
181 aa  110  9e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0412  hypothetical protein  39.66 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3406  protein of unknown function DUF204  37.89 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000037692  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0090  membrane protein  36.46 
 
 
184 aa  108  3e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0210402  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0221  hypothetical protein  32.97 
 
 
185 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2522  protein of unknown function DUF204  39.74 
 
 
187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0555852 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1449  protein of unknown function DUF204  38.3 
 
 
189 aa  108  5e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.290539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0247  hypothetical protein  33.73 
 
 
186 aa  106  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2070  hypothetical protein  35.93 
 
 
188 aa  105  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000608383  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1654  membrane protein  35.16 
 
 
182 aa  105  4e-22  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1700  protein of unknown function DUF204  39.07 
 
 
188 aa  105  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000050274  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1800  cell division protein  32.96 
 
 
185 aa  104  9e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145109  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1232  protein of unknown function DUF204  33.33 
 
 
188 aa  102  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0963  hypothetical protein  36.36 
 
 
193 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044765  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1326  hypothetical protein  34.24 
 
 
185 aa  100  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000767112 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_952  hypothetical protein  36.02 
 
 
193 aa  100  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1134  hypothetical protein  35.48 
 
 
193 aa  99  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000076644  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1531  hypothetical protein  35.48 
 
 
189 aa  98.2  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000880885  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3146  hypothetical protein  36.11 
 
 
181 aa  97.8  8e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.120632  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1339  hypothetical protein  38.55 
 
 
182 aa  94.4  9e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03700  predicted membrane protein  33.88 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0724834  normal  0.0195872 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2978  hypothetical protein  34.55 
 
 
190 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0770545  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0431  hypothetical protein  30.16 
 
 
182 aa  90.5  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608488  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0024  protein of unknown function DUF204  29.08 
 
 
199 aa  87.8  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.992365 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4106  hypothetical protein  53.49 
 
 
94 aa  87  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67969  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0607  hypothetical protein  33.92 
 
 
185 aa  87  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.686733 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0006  hypothetical protein  33.51 
 
 
195 aa  85.5  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000857448  hitchhiker  0.000000941545 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0005  hypothetical protein  33.68 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.33307  hitchhiker  0.000135585 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1107  protein of unknown function DUF204  32.45 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2150  hypothetical protein  31.32 
 
 
180 aa  80.5  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3288  hypothetical protein  36.52 
 
 
181 aa  79  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00723105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5447  hypothetical protein  30.22 
 
 
182 aa  79  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00491428  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4180  protein of unknown function DUF204  33.33 
 
 
181 aa  77.8  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000492866  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5173  hypothetical protein  29.67 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124762  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5567  hypothetical protein  29.67 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000345667  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21610  predicted membrane protein  34.04 
 
 
188 aa  77.4  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.890881  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5416  hypothetical protein  29.67 
 
 
182 aa  77  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>