118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0412 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0412  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  355  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1637  hypothetical protein  39.01 
 
 		 190 aa  126  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000104558  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6717  protein of unknown function DUF204  43.58 
 
 		 189 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1420  hypothetical protein  37.78 
 
 		 198 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000356412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7389  hypothetical protein  39.78 
 
 		 185 aa  122  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3406  protein of unknown function DUF204  40.56 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000037692  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4096  hypothetical protein  40.64 
 
 		 188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2300  protein of unknown function DUF204  39.44 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168239  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0162  hypothetical protein  39.23 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0202  hypothetical protein  39.23 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26450  hypothetical protein  42.39 
 
 		 189 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0067592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0180  hypothetical protein  38.67 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4397  hypothetical protein  41.08 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3755  hypothetical protein  40.66 
 
 		 190 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1922  hypothetical protein  40.22 
 
 		 190 aa  114  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0107711  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1273  protein of unknown function DUF204  40.48 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0455  hypothetical protein  39.89 
 
 		 201 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1979  protein of unknown function DUF204  41.34 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0850567  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2215  protein of unknown function DUF204  39.66 
 
 		 190 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000652284  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2817  hypothetical protein  39.66 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2025  protein of unknown function DUF204  39.66 
 
 		 190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.331767  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02440  predicted membrane protein  37.29 
 
 		 188 aa  108  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1725  hypothetical protein  40.45 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.113656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1725  membrane protein  37.22 
 
 		 181 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02753  membrane protein YebN  35.45 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2698  hypothetical protein  39.11 
 
 		 188 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2102  protein of unknown function DUF204  40.68 
 
 		 187 aa  107  9.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01791  conserved inner membrane protein  38.76 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000275472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1822  protein of unknown function DUF204  38.76 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1911  hypothetical protein  38.76 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2050  hypothetical protein  38.76 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904735  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1800  cell division protein  37.78 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145109  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1811  hypothetical protein  38.76 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035153  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1366  hypothetical protein  38.76 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000222622  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2088  hypothetical protein  38.76 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111578  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2553  hypothetical protein  38.76 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000161529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01779  hypothetical protein  38.76 
 
 		 188 aa  106  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0169  hypothetical protein  40.22 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0582561  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1412  protein of unknown function DUF204  35.68 
 
 		 189 aa  105  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000313106  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2453  protein of unknown function DUF204  37.85 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3656  protein of unknown function DUF204  37.85 
 
 		 187 aa  104  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00251893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1654  membrane protein  36.81 
 
 		 182 aa  102  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1974  membrane protein YebN  38.2 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  0.466937 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2035  membrane protein YebN  38.2 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1978  membrane protein YebN  38.2 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1297  membrane protein YebN  38.2 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00128571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1481  membrane protein YebN  38.2 
 
 		 188 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2187  protein of unknown function DUF204  36.16 
 
 		 189 aa  102  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480429 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3977  protein of unknown function DUF204  38.5 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.164698 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1799  protein of unknown function DUF204  37.99 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.971603 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1699  protein of unknown function DUF204  36.17 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0090  membrane protein  38.67 
 
 		 184 aa  99  3e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0210402  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2390  hypothetical protein  39.38 
 
 		 200 aa  98.6  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2372  hypothetical protein  37.64 
 
 		 189 aa  97.8  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000118461  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1655  hypothetical protein  37.64 
 
 		 189 aa  97.8  7e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000365012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2468  hypothetical protein  37.64 
 
 		 189 aa  97.8  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00922383  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0559  protein of unknown function DUF204  37.36 
 
 		 179 aa  95.1  5e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.179338  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_952  hypothetical protein  33.7 
 
 		 193 aa  93.6  1e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1449  protein of unknown function DUF204  35.16 
 
 		 189 aa  93.2  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.290539  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1192  hypothetical protein  32.39 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1700  protein of unknown function DUF204  40.14 
 
 		 188 aa  92.8  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000050274  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3146  hypothetical protein  36.9 
 
 		 181 aa  92.8  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.120632  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03700  predicted membrane protein  34.64 
 
 		 185 aa  92.8  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0724834  normal  0.0195872 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2522  protein of unknown function DUF204  39.01 
 
 		 187 aa  92.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0555852 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0282  hypothetical protein  40.32 
 
 		 193 aa  92.4  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0273862  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1134  hypothetical protein  34.57 
 
 		 193 aa  91.7  5e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000076644  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2070  hypothetical protein  35.62 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000608383  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0503  hypothetical protein  33.51 
 
 		 213 aa  91.3  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0516  hypothetical protein  34.57 
 
 		 213 aa  90.1  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4533  hypothetical protein  40.45 
 
 		 188 aa  88.6  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0109117 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21610  predicted membrane protein  34.27 
 
 		 188 aa  86.7  2e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.890881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1531  hypothetical protein  36.52 
 
 		 189 aa  85.9  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000880885  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0963  hypothetical protein  33.51 
 
 		 193 aa  85.5  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044765  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2322  protein of unknown function DUF204  32.58 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1339  hypothetical protein  36.13 
 
 		 182 aa  84.7  6e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1326  hypothetical protein  33.7 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767112 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2978  hypothetical protein  33.13 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0770545  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02600  predicted membrane protein  35.03 
 
 		 194 aa  81.6  0.000000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000087208  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1363  hypothetical protein  33.79 
 
 		 189 aa  81.3  0.000000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2039  hypothetical protein  36.31 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0168  hypothetical protein  35.14 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0006  hypothetical protein  33.17 
 
 		 195 aa  79.7  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000857448  hitchhiker  0.000000941545 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1452  hypothetical protein  34.95 
 
 		 194 aa  77.4  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.960759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3288  hypothetical protein  34.62 
 
 		 181 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00723105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4106  hypothetical protein  45.65 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67969  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1382  hypothetical protein  34.24 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.321925  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0607  hypothetical protein  32.72 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.686733 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0431  hypothetical protein  27.78 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0247  hypothetical protein  29.75 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0221  hypothetical protein  28.41 
 
 		 185 aa  72  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1232  protein of unknown function DUF204  29.12 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5451  hypothetical protein  28.32 
 
 		 182 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.192509  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5447  hypothetical protein  28.32 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00491428  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5505  hypothetical protein  28.32 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000039704  unclonable  3.9395e-26 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5173  hypothetical protein  28.32 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.124762  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5008  integral membrane protein  28.32 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0149055  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5567  hypothetical protein  28.32 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000345667  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5416  hypothetical protein  28.32 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.71148e-62 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0005  hypothetical protein  33.85 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.33307  hitchhiker  0.000135585 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5502  hypothetical protein  27.17 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000153104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>