129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1700 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1700  protein of unknown function DUF204  100 
 
 		 188 aa  370  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000050274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2522  protein of unknown function DUF204  96.81 
 
 		 187 aa  336  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0555852 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2070  hypothetical protein  66.67 
 
 		 188 aa  240  7.999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000608383  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0455  hypothetical protein  55.38 
 
 		 201 aa  206  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.703448 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1531  hypothetical protein  56.45 
 
 		 189 aa  198  5e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000880885  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1799  protein of unknown function DUF204  58.01 
 
 		 190 aa  192  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.971603 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2322  protein of unknown function DUF204  53.51 
 
 		 186 aa  178  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2978  hypothetical protein  53.01 
 
 		 190 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0770545  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2187  protein of unknown function DUF204  45.11 
 
 		 189 aa  164  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00480429 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0431  hypothetical protein  45.71 
 
 		 182 aa  155  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.608488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3656  protein of unknown function DUF204  41.53 
 
 		 187 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00251893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2453  protein of unknown function DUF204  41.53 
 
 		 187 aa  150  7e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1192  hypothetical protein  43.18 
 
 		 194 aa  148  4e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1637  hypothetical protein  40.76 
 
 		 190 aa  147  7e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000104558  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_952  hypothetical protein  44.92 
 
 		 193 aa  144  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000000542228  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02440  predicted membrane protein  44.07 
 
 		 188 aa  144  5e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.307428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1699  protein of unknown function DUF204  43.78 
 
 		 193 aa  144  6e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.853895  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1134  hypothetical protein  41.18 
 
 		 193 aa  144  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000076644  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0963  hypothetical protein  44.39 
 
 		 193 aa  143  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000044765  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0168  hypothetical protein  45.45 
 
 		 192 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2102  protein of unknown function DUF204  47.83 
 
 		 187 aa  137  7.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2039  hypothetical protein  45.65 
 
 		 185 aa  137  1e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4533  hypothetical protein  47.83 
 
 		 188 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0109117 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2698  hypothetical protein  39.13 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1420  hypothetical protein  39.46 
 
 		 198 aa  132  3e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000356412  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0221  hypothetical protein  39.89 
 
 		 185 aa  130  7.999999999999999e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1979  protein of unknown function DUF204  40.11 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0850567  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1273  protein of unknown function DUF204  44.62 
 
 		 192 aa  130  1.0000000000000001e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.08544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4096  hypothetical protein  41.71 
 
 		 188 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6717  protein of unknown function DUF204  39.13 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0704684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0162  hypothetical protein  39.67 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0202  hypothetical protein  39.67 
 
 		 187 aa  129  2.0000000000000002e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.356738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2300  protein of unknown function DUF204  40.76 
 
 		 186 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000168239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0247  hypothetical protein  40.96 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0180  hypothetical protein  39.13 
 
 		 187 aa  125  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1922  hypothetical protein  37.84 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0107711  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0516  hypothetical protein  40 
 
 		 213 aa  125  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1725  membrane protein  37.85 
 
 		 181 aa  124  6e-28  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1232  protein of unknown function DUF204  43.75 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0811336 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1412  protein of unknown function DUF204  37.5 
 
 		 189 aa  124  1e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000313106  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0503  hypothetical protein  39.51 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2215  protein of unknown function DUF204  37.3 
 
 		 190 aa  122  3e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000652284  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3406  protein of unknown function DUF204  43.17 
 
 		 190 aa  122  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000037692  hitchhiker  0.0000275934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26450  hypothetical protein  37.1 
 
 		 189 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0067592  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2025  protein of unknown function DUF204  37.84 
 
 		 190 aa  121  6e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.331767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3755  hypothetical protein  36.76 
 
 		 190 aa  121  7e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.190288  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01791  conserved inner membrane protein  38.42 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000275472  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1822  protein of unknown function DUF204  38.42 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01779  hypothetical protein  38.42 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360524  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1911  hypothetical protein  38.42 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000166044  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2050  hypothetical protein  38.42 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000904735  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1811  hypothetical protein  38.42 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035153  normal  0.497316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1366  hypothetical protein  38.42 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000222622  normal  0.0184788 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2088  hypothetical protein  38.42 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000111578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02753  membrane protein YebN  41.05 
 
 		 232 aa  120  8e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2553  hypothetical protein  38.42 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000161529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0607  hypothetical protein  42.69 
 
 		 185 aa  119  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.686733 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3977  protein of unknown function DUF204  41.4 
 
 		 191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.765114  normal  0.164698 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1974  membrane protein YebN  38.42 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.816628  normal  0.466937 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2035  membrane protein YebN  37.3 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.452254  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1978  membrane protein YebN  38.42 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1297  membrane protein YebN  38.42 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00128571  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1481  membrane protein YebN  38.42 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.908225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2817  hypothetical protein  36.96 
 
 		 189 aa  117  7.999999999999999e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000019593 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1725  hypothetical protein  37.57 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.113656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1654  membrane protein  34.25 
 
 		 182 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1800  cell division protein  36.07 
 
 		 185 aa  115  3.9999999999999997e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145109  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7389  hypothetical protein  36.22 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0282  hypothetical protein  41.56 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0273862  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0559  protein of unknown function DUF204  38.15 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.179338  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2372  hypothetical protein  38.64 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000118461  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4397  hypothetical protein  38.38 
 
 		 232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1655  hypothetical protein  38.64 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000365012  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2468  hypothetical protein  38.64 
 
 		 189 aa  110  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00922383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02600  predicted membrane protein  36.96 
 
 		 194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000087208  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1326  hypothetical protein  36.36 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000767112 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2390  hypothetical protein  37.74 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0400913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1449  protein of unknown function DUF204  37.57 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.290539  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21610  predicted membrane protein  35.83 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.890881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0090  membrane protein  37.42 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0210402  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3288  hypothetical protein  37.14 
 
 		 181 aa  101  7e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00723105  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0412  hypothetical protein  36.36 
 
 		 184 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3146  hypothetical protein  34.46 
 
 		 181 aa  98.2  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.120632  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0169  hypothetical protein  34.74 
 
 		 196 aa  97.4  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0582561  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0006  hypothetical protein  31.96 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000857448  hitchhiker  0.000000941545 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1452  hypothetical protein  39.15 
 
 		 194 aa  95.5  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.960759  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4830  protein of unknown function DUF204  35.71 
 
 		 195 aa  95.5  4e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0117076  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03700  predicted membrane protein  35.36 
 
 		 185 aa  95.1  5e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0724834  normal  0.0195872 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0005  hypothetical protein  33.16 
 
 		 197 aa  94  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.33307  hitchhiker  0.000135585 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1107  protein of unknown function DUF204  32.45 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0024  protein of unknown function DUF204  33.69 
 
 		 199 aa  92.4  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.992365 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1382  hypothetical protein  38.1 
 
 		 194 aa  91.7  5e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.321925  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1363  hypothetical protein  36.92 
 
 		 189 aa  89.4  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0007  hypothetical protein  32.12 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0975512  hitchhiker  0.00984847 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1339  hypothetical protein  34.03 
 
 		 182 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.717707 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4180  protein of unknown function DUF204  31.69 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000492866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3318  protein of unknown function DUF204  32.2 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.861513  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3165  hypothetical protein  32.42 
 
 		 180 aa  78.6  0.00000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000676254  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5447  hypothetical protein  30.64 
 
 		 182 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00491428  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3431  protein of unknown function DUF204  32.18 
 
 		 183 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>