42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0062 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  851    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  30.18 
 
 		 422 aa  123  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1908  hypothetical protein  27.52 
 
 		 413 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  27.49 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  32.62 
 
 		 393 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  27.24 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1153  hypothetical protein  30.46 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2336  hypothetical protein  28.03 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0189612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3271  hypothetical protein  29.15 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3382  hypothetical protein  26.76 
 
 		 395 aa  92.4  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4333  hypothetical protein  25.87 
 
 		 434 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.989415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1587  hypothetical protein  30.83 
 
 		 355 aa  87.8  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.748272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4324  hypothetical protein  28.73 
 
 		 328 aa  84.7  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.404094  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2654  hypothetical protein  30.5 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113589  normal  0.0183141 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3239  hypothetical protein  27.24 
 
 		 414 aa  78.2  0.0000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1919  hypothetical protein  27.31 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0709  hypothetical protein  27.81 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1480  hypothetical protein  29.73 
 
 		 394 aa  73.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3822  hypothetical protein  26.84 
 
 		 395 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333872  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2702  hypothetical protein  27.19 
 
 		 399 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4908  hypothetical protein  25.89 
 
 		 366 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.061778  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1589  hypothetical protein  24.33 
 
 		 397 aa  70.5  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5038  hypothetical protein  26.04 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2515  hypothetical protein  21.67 
 
 		 385 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2894  hypothetical protein  24.78 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0595  hypothetical protein  27.41 
 
 		 370 aa  65.5  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4505  hypothetical protein  26.12 
 
 		 377 aa  63.9  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0101  hypothetical protein  25.35 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.867237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2550  hypothetical protein  27.18 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0136518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2446  hypothetical protein  26.42 
 
 		 364 aa  57.8  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.011853  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3746  hypothetical protein  22.41 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00354486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3377  hypothetical protein  27.27 
 
 		 363 aa  57  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.718952  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1427  hypothetical protein  28.26 
 
 		 367 aa  55.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.617063  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1539  hypothetical protein  26.05 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3101  hypothetical protein  25.5 
 
 		 382 aa  55.1  0.000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0569  hypothetical protein  31.75 
 
 		 389 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4551  hypothetical protein  27.59 
 
 		 376 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3011  hypothetical protein  28.48 
 
 		 357 aa  48.5  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0216  hypothetical protein  25 
 
 		 360 aa  45.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367954  normal  0.621214 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2498  hypothetical protein  26.82 
 
 		 363 aa  43.9  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01319  hypothetical protein  20.45 
 
 		 361 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1212  hypothetical protein  23.39 
 
 		 378 aa  43.5  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>