24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2702 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2702  hypothetical protein  100 
 
 
399 aa  815    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2336  hypothetical protein  28.73 
 
 
401 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0189612 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3271  hypothetical protein  29.37 
 
 
404 aa  150  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1153  hypothetical protein  31.72 
 
 
396 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3382  hypothetical protein  25.25 
 
 
395 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127252  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  26.82 
 
 
422 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  29.48 
 
 
411 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1587  hypothetical protein  28.27 
 
 
355 aa  106  6e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.748272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4333  hypothetical protein  24.73 
 
 
434 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.989415  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  29.17 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  27.19 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1480  hypothetical protein  26.43 
 
 
394 aa  70.5  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0569  hypothetical protein  23.86 
 
 
389 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  20.57 
 
 
390 aa  67  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2654  hypothetical protein  23.23 
 
 
380 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113589  normal  0.0183141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5038  hypothetical protein  25 
 
 
393 aa  60.5  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4324  hypothetical protein  29.17 
 
 
328 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.404094  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00193  hypothetical protein  28.68 
 
 
404 aa  56.6  0.0000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2894  hypothetical protein  27.4 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0216  hypothetical protein  25.96 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367954  normal  0.621214 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4908  hypothetical protein  24.05 
 
 
366 aa  50.1  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.061778  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3746  hypothetical protein  29.17 
 
 
394 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00354486  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1589  hypothetical protein  23.25 
 
 
397 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3239  hypothetical protein  28.05 
 
 
414 aa  43.9  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>