21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0709 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0709  hypothetical protein  100 
 
 		 372 aa  749    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0101  hypothetical protein  48.18 
 
 		 366 aa  284  2.0000000000000002e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.867237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2498  hypothetical protein  48.31 
 
 		 363 aa  261  1e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0595  hypothetical protein  39.89 
 
 		 370 aa  221  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28067 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3101  hypothetical protein  38.94 
 
 		 382 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1212  hypothetical protein  36.28 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1539  hypothetical protein  37.12 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2550  hypothetical protein  36.68 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0136518 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3571  hypothetical protein  38.17 
 
 		 337 aa  189  8e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.487226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1427  hypothetical protein  38.32 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.617063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2446  hypothetical protein  34.71 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.011853  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01319  hypothetical protein  29.66 
 
 		 361 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436322  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1372  hypothetical protein  36.25 
 
 		 338 aa  137  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.119661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  27.81 
 
 		 424 aa  73.9  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4324  hypothetical protein  27.65 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.404094  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4333  hypothetical protein  26.67 
 
 		 434 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.989415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2829  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  50.1  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2515  hypothetical protein  22.11 
 
 		 385 aa  49.7  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3822  hypothetical protein  25.78 
 
 		 395 aa  47  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333872  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4505  hypothetical protein  25.62 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1908  hypothetical protein  26.7 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>