29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4324 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4324  hypothetical protein  100 
 
 
328 aa  656    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.404094  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  30.12 
 
 
393 aa  96.7  5e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  29.8 
 
 
424 aa  82.4  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3822  hypothetical protein  27.69 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333872  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  26.92 
 
 
422 aa  66.2  0.0000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1153  hypothetical protein  29.77 
 
 
396 aa  66.2  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2336  hypothetical protein  28.57 
 
 
401 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0189612 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2702  hypothetical protein  29.17 
 
 
399 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2654  hypothetical protein  22.28 
 
 
380 aa  58.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113589  normal  0.0183141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2446  hypothetical protein  26.84 
 
 
364 aa  58.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.011853  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3382  hypothetical protein  21.76 
 
 
395 aa  54.3  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127252  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0569  hypothetical protein  27.23 
 
 
389 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4908  hypothetical protein  28.93 
 
 
366 aa  53.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.061778  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1908  hypothetical protein  28.5 
 
 
413 aa  52.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1919  hypothetical protein  23.91 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3271  hypothetical protein  29.08 
 
 
404 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  27.12 
 
 
411 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1587  hypothetical protein  32.17 
 
 
355 aa  51.2  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.748272  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  28.7 
 
 
390 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3571  hypothetical protein  25.86 
 
 
337 aa  49.7  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.487226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4551  hypothetical protein  32.71 
 
 
376 aa  49.3  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4505  hypothetical protein  27.33 
 
 
377 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0709  hypothetical protein  27.65 
 
 
372 aa  47.8  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01319  hypothetical protein  26.37 
 
 
361 aa  47.4  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436322  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5038  hypothetical protein  23.13 
 
 
393 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4333  hypothetical protein  27.95 
 
 
434 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.989415  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0310  hypothetical protein  33.33 
 
 
314 aa  43.5  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1589  hypothetical protein  28.41 
 
 
397 aa  43.5  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1480  hypothetical protein  27.59 
 
 
394 aa  42.7  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>