18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1427 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1427  hypothetical protein  100 
 
 
367 aa  725    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.617063  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2446  hypothetical protein  42.86 
 
 
364 aa  249  7e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.011853  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0101  hypothetical protein  39.55 
 
 
366 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.867237  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0709  hypothetical protein  38.69 
 
 
372 aa  181  1e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2498  hypothetical protein  40.17 
 
 
363 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0595  hypothetical protein  36.36 
 
 
370 aa  161  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.28067 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1212  hypothetical protein  31.66 
 
 
378 aa  146  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3101  hypothetical protein  34.64 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1539  hypothetical protein  36.09 
 
 
377 aa  140  3e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01319  hypothetical protein  31.29 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436322  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3571  hypothetical protein  40.62 
 
 
337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.487226 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2550  hypothetical protein  34.78 
 
 
372 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0136518 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1372  hypothetical protein  37.15 
 
 
338 aa  97.1  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.119661  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4505  hypothetical protein  30.63 
 
 
377 aa  68.9  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3822  hypothetical protein  27.17 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333872  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  28.26 
 
 
424 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1153  hypothetical protein  26.62 
 
 
396 aa  49.7  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3377  hypothetical protein  29.76 
 
 
363 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.718952  normal  0.0514733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>