20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2446 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2446  hypothetical protein  100 
 
 
364 aa  744    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.011853  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1427  hypothetical protein  43.14 
 
 
367 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.617063  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0595  hypothetical protein  35.57 
 
 
370 aa  189  8e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.28067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0709  hypothetical protein  35 
 
 
372 aa  171  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0101  hypothetical protein  33.33 
 
 
366 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.867237  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2498  hypothetical protein  36.13 
 
 
363 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1212  hypothetical protein  29.15 
 
 
378 aa  155  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3101  hypothetical protein  33.91 
 
 
382 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2550  hypothetical protein  33.63 
 
 
372 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0136518 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1539  hypothetical protein  32.64 
 
 
377 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3571  hypothetical protein  34.57 
 
 
337 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.487226 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01319  hypothetical protein  27.89 
 
 
361 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436322  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1372  hypothetical protein  31.49 
 
 
338 aa  116  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.119661  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  28.43 
 
 
424 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4324  hypothetical protein  27.03 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.404094  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4505  hypothetical protein  29.55 
 
 
377 aa  62.4  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3822  hypothetical protein  28.12 
 
 
395 aa  60.1  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333872  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  26.6 
 
 
393 aa  53.5  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  29.81 
 
 
422 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4551  hypothetical protein  29.11 
 
 
376 aa  43.1  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.339359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>