22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0595 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0595  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  736    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.28067 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0101  hypothetical protein  41.85 
 
 
366 aa  233  4.0000000000000004e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.867237  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0709  hypothetical protein  39.83 
 
 
372 aa  208  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2550  hypothetical protein  36.24 
 
 
372 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0136518 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1539  hypothetical protein  36.87 
 
 
377 aa  187  3e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2446  hypothetical protein  34.45 
 
 
364 aa  181  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.011853  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2498  hypothetical protein  36.89 
 
 
363 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3571  hypothetical protein  38.3 
 
 
337 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.487226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1212  hypothetical protein  33.14 
 
 
378 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3101  hypothetical protein  35.1 
 
 
382 aa  166  5e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1427  hypothetical protein  35.83 
 
 
367 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.617063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1372  hypothetical protein  35.47 
 
 
338 aa  150  5e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.119661  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01319  hypothetical protein  29.28 
 
 
361 aa  142  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436322  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4333  hypothetical protein  24.76 
 
 
434 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.989415  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  27.41 
 
 
424 aa  58.5  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  24.18 
 
 
422 aa  55.5  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2515  hypothetical protein  20.96 
 
 
385 aa  53.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1587  hypothetical protein  26.61 
 
 
355 aa  50.8  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.748272  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1908  hypothetical protein  26 
 
 
413 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3377  hypothetical protein  24.29 
 
 
363 aa  46.6  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.718952  normal  0.0514733 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3822  hypothetical protein  24.12 
 
 
395 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333872  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3382  hypothetical protein  26.35 
 
 
395 aa  43.5  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>