36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0087 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  100 
 
 		 422 aa  853    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  33.99 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1153  hypothetical protein  33.16 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4333  hypothetical protein  32.14 
 
 		 434 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.989415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  29.97 
 
 		 390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2336  hypothetical protein  26.7 
 
 		 401 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0189612 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3382  hypothetical protein  25.78 
 
 		 395 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127252  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1587  hypothetical protein  32.59 
 
 		 355 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.748272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2702  hypothetical protein  26.82 
 
 		 399 aa  119  7e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3271  hypothetical protein  26.33 
 
 		 404 aa  112  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  30.18 
 
 		 424 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  30.51 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1589  hypothetical protein  23.56 
 
 		 397 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5038  hypothetical protein  23.35 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1908  hypothetical protein  28.87 
 
 		 413 aa  72  0.00000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4324  hypothetical protein  26.92 
 
 		 328 aa  66.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.404094  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4551  hypothetical protein  33.77 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.339359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0569  hypothetical protein  22.37 
 
 		 389 aa  63.9  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1969  hypothetical protein  31.76 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.256858  normal  0.306966 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0101  hypothetical protein  25.69 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.867237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1919  hypothetical protein  24.14 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1480  hypothetical protein  28.57 
 
 		 394 aa  61.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3822  hypothetical protein  24.36 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.333872  normal  0.578419 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3239  hypothetical protein  25.18 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0595  hypothetical protein  24.18 
 
 		 370 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2654  hypothetical protein  19.61 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.113589  normal  0.0183141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3101  hypothetical protein  28.57 
 
 		 382 aa  53.1  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1212  hypothetical protein  34.15 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0328457 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0216  hypothetical protein  23.78 
 
 		 360 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367954  normal  0.621214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4505  hypothetical protein  25.08 
 
 		 377 aa  50.8  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2553  hypothetical protein  34.15 
 
 		 378 aa  51.2  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3011  hypothetical protein  26.96 
 
 		 357 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2515  hypothetical protein  22.37 
 
 		 385 aa  48.5  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4908  hypothetical protein  28.42 
 
 		 366 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.061778  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2894  hypothetical protein  22.22 
 
 		 397 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3746  hypothetical protein  22.14 
 
 		 394 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00354486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>