13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1212 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1212  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  785    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0709  hypothetical protein  36.28 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3101  hypothetical protein  35.78 
 
 		 382 aa  171  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0595  hypothetical protein  33.14 
 
 		 370 aa  166  4e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28067 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0101  hypothetical protein  31.39 
 
 		 366 aa  160  4e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.867237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01319  hypothetical protein  32.03 
 
 		 361 aa  159  7e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436322  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2498  hypothetical protein  34.42 
 
 		 363 aa  155  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1539  hypothetical protein  32.63 
 
 		 377 aa  153  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2550  hypothetical protein  31.25 
 
 		 372 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0136518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2446  hypothetical protein  29.15 
 
 		 364 aa  150  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.011853  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3571  hypothetical protein  32.31 
 
 		 337 aa  143  6e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.487226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1427  hypothetical protein  31.76 
 
 		 367 aa  143  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.617063  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1372  hypothetical protein  30.52 
 
 		 338 aa  116  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.119661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>