19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4908 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4908  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  756    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.061778  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3271  hypothetical protein  36.75 
 
 		 404 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  23.92 
 
 		 390 aa  77  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0569  hypothetical protein  25.82 
 
 		 389 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  25.89 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1153  hypothetical protein  26.06 
 
 		 396 aa  70.1  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2336  hypothetical protein  26.88 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0189612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  26.71 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5038  hypothetical protein  27.74 
 
 		 393 aa  58.5  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4324  hypothetical protein  28.93 
 
 		 328 aa  53.1  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.404094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3382  hypothetical protein  23.74 
 
 		 395 aa  52.8  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1589  hypothetical protein  24.12 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2894  hypothetical protein  26.62 
 
 		 397 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2702  hypothetical protein  24.05 
 
 		 399 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  28.42 
 
 		 422 aa  48.1  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1587  hypothetical protein  24.84 
 
 		 355 aa  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.748272  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3239  hypothetical protein  25.16 
 
 		 414 aa  47.8  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  21.84 
 
 		 393 aa  44.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3746  hypothetical protein  25.85 
 
 		 394 aa  43.9  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00354486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>