17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5038 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_5038  hypothetical protein  100 
 
 
393 aa  818    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1153  hypothetical protein  26.65 
 
 
396 aa  92  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  23.35 
 
 
422 aa  73.2  0.000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2336  hypothetical protein  23.28 
 
 
401 aa  67  0.0000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0189612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  24.8 
 
 
411 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  26.02 
 
 
424 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2702  hypothetical protein  25 
 
 
399 aa  60.5  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3271  hypothetical protein  20.49 
 
 
404 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4908  hypothetical protein  27.74 
 
 
366 aa  58.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.061778  normal  0.0925574 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1587  hypothetical protein  26.59 
 
 
355 aa  58.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.748272  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  24.73 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0569  hypothetical protein  23.18 
 
 
389 aa  55.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3382  hypothetical protein  20.89 
 
 
395 aa  53.1  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127252  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  19.75 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1908  hypothetical protein  23.53 
 
 
413 aa  46.6  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4324  hypothetical protein  23.13 
 
 
328 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.404094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1589  hypothetical protein  21.64 
 
 
397 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>