10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0216 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0216  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  733    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367954  normal  0.621214 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3011  hypothetical protein  40 
 
 		 357 aa  176  5e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4104  hypothetical protein  30.89 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2702  hypothetical protein  25.96 
 
 		 399 aa  51.2  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  23.78 
 
 		 422 aa  51.2  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1480  hypothetical protein  27.31 
 
 		 394 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1919  hypothetical protein  26.11 
 
 		 380 aa  47.8  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  27.07 
 
 		 390 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01319  hypothetical protein  19.78 
 
 		 361 aa  43.1  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436322  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  27.42 
 
 		 393 aa  43.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>