18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1919 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1919  hypothetical protein  100 
 
 
380 aa  749    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4505  hypothetical protein  32.48 
 
 
377 aa  119  7.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4333  hypothetical protein  29.58 
 
 
434 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.989415  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3271  hypothetical protein  25.67 
 
 
404 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1153  hypothetical protein  25.77 
 
 
396 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1587  hypothetical protein  29.05 
 
 
355 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.748272  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3382  hypothetical protein  23.08 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127252  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0062  hypothetical protein  26.98 
 
 
424 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1908  hypothetical protein  26.3 
 
 
413 aa  67  0.0000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0087  hypothetical protein  24.52 
 
 
422 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.113697  unclonable  0.0000108237 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2336  hypothetical protein  22.06 
 
 
401 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0189612 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2955  hypothetical protein  27.39 
 
 
411 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.202209  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3358  hypothetical protein  21.89 
 
 
390 aa  53.9  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.342415 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4324  hypothetical protein  23.91 
 
 
328 aa  53.1  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.404094  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1589  hypothetical protein  23.08 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2793  hypothetical protein  25.33 
 
 
393 aa  49.7  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0569  hypothetical protein  24.81 
 
 
389 aa  49.7  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.420065  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0216  hypothetical protein  26.11 
 
 
360 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.367954  normal  0.621214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>