36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0638 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0638  glycosyl transferase family 2  100 
 
 		 260 aa  535  1e-151  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1547  hypothetical protein  42.97 
 
 		 265 aa  198  9e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0128951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2993  hypothetical protein  41.83 
 
 		 265 aa  195  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5932  succinoglycan biosynthesis protein  35.96 
 
 		 319 aa  57  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  25.77 
 
 		 352 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1539  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 335 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1731  glycosyl transferase family 2  31.58 
 
 		 373 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.233298  normal  0.192393 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0190  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 335 aa  50.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.801609 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2495  glycosyl transferase family 2  26.05 
 
 		 345 aa  49.7  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.519767  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2946  glycosyl transferase family protein  31.43 
 
 		 335 aa  49.3  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.765894  normal  0.180956 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0633  glycosyl transferase family 2  30 
 
 		 345 aa  49.3  0.00007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.810954  normal  0.460894 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1953  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.304732 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3455  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 		 315 aa  48.5  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.91 
 
 		 326 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4914  family 2 glycosyl transferase  27 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7004  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 155 aa  46.2  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1917  glycosyl transferase family protein  26.11 
 
 		 317 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795527 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3254  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.68 
 
 		 314 aa  45.8  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106646  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3148  glycosyl transferase family 2  25 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8503  glycosyl transferase family 2  30.17 
 
 		 280 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.396799  normal  0.0440805 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1738  glycosyltransferase-like protein  28.57 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  24.21 
 
 		 327 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1811  glycosyl transferase family protein  24.86 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0703738  normal  0.241248 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  24.82 
 
 		 343 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3249  glycosyl transferase family 2  22.22 
 
 		 261 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0399034  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  27.27 
 
 		 386 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2010  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 305 aa  43.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.887395 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4231  glycosyl transferase family protein  30.69 
 
 		 360 aa  43.1  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.921213 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  22.87 
 
 		 302 aa  43.1  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3730  glycosyl transferase family protein  32.93 
 
 		 336 aa  42.7  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.202885 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  26.92 
 
 		 672 aa  42.4  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6233  glycosyl transferase family 2  30.51 
 
 		 316 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121855  normal  0.472399 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2759  glycosyl transferase family protein  29.35 
 
 		 340 aa  42.4  0.009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5782  glycosyl transferase family 2  32.32 
 
 		 317 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3973  glycosyl transferase family 2  25.69 
 
 		 525 aa  42  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0772213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  26.73 
 
 		 1250 aa  42  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>