19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0680 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0680  hypothetical protein  100 
 
 		 99 aa  204  3e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1277  major facilitator transporter  73.21 
 
 		 410 aa  88.6  3e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1077  major facilitator transporter  46.38 
 
 		 403 aa  63.5  0.0000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1550  major facilitator superfamily transporter  48.28 
 
 		 426 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464954 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1175  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 419 aa  53.9  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0759672  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3453  major facilitator superfamily MFS_1  42.86 
 
 		 420 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  0.0945543 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5135  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 422 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.203092 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3614  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 439 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3292  major facilitator superfamily MFS_1  37.93 
 
 		 439 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1090  major facilitator transporter  33.33 
 
 		 418 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0155468 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0461  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 420 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4255  Arabinose efflux permease-like protein  36.73 
 
 		 217 aa  47  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3965  major facilitator transporter  37.5 
 
 		 413 aa  46.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.748751  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21230  catecholate siderophore efflux pump, MFS_1 family  39.29 
 
 		 407 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.000768503  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5307  major facilitator superfamily MFS_1  35.38 
 
 		 424 aa  46.2  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.535267  normal  0.123974 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3400  tranporter transmembrane protein  34.78 
 
 		 421 aa  45.4  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0325  sugar efflux transporter  32.39 
 
 		 403 aa  43.5  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2421  major facilitator transporter  42.31 
 
 		 384 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2688  major facilitator family transporter  40.38 
 
 		 384 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>