46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4502 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4502  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  652    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5231  Protein of unknown function DUF2090  47 
 
 		 305 aa  283  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5794  hypothetical protein  42.57 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4188  hypothetical protein  33.9 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  28.15 
 
 		 630 aa  96.3  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  29.06 
 
 		 642 aa  78.6  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  25.96 
 
 		 647 aa  76.3  0.0000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  24.05 
 
 		 634 aa  75.9  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  28.43 
 
 		 636 aa  75.1  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  25.34 
 
 		 652 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  25.82 
 
 		 634 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  23.71 
 
 		 634 aa  73.6  0.000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  25.43 
 
 		 625 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  25.43 
 
 		 656 aa  69.7  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  24.58 
 
 		 636 aa  69.3  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  25.43 
 
 		 644 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  25.43 
 
 		 654 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  24.38 
 
 		 647 aa  66.6  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  23.55 
 
 		 643 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  25.68 
 
 		 655 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  22.33 
 
 		 645 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  25.77 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  26.95 
 
 		 666 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  22.82 
 
 		 633 aa  63.5  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  25.09 
 
 		 645 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  24.58 
 
 		 646 aa  62.4  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  26.1 
 
 		 640 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  25.7 
 
 		 666 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  25.7 
 
 		 666 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  25.7 
 
 		 666 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  25.7 
 
 		 666 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  25.7 
 
 		 666 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  25.7 
 
 		 666 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  25.7 
 
 		 666 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  22.13 
 
 		 680 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  21.77 
 
 		 681 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  22.26 
 
 		 670 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  28.57 
 
 		 635 aa  53.1  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  22.41 
 
 		 645 aa  52.4  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  24.81 
 
 		 659 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  22.61 
 
 		 642 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  23.15 
 
 		 651 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  22.77 
 
 		 651 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  22.77 
 
 		 651 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  22.48 
 
 		 652 aa  45.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  23.41 
 
 		 651 aa  44.3  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.333312 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>