78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4359 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008757  Pnap_4359  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
751 aa  1532    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.369911  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1262  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.58 
 
 
769 aa  413  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.772554  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2740  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.92 
 
 
751 aa  83.2  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493167  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.92 
 
 
751 aa  83.2  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.500169  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3185  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.23 
 
 
725 aa  82.4  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.384738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3040  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  25.67 
 
 
751 aa  80.9  0.00000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.299146 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0356  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.45 
 
 
771 aa  76.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.952881  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2048  hypothetical protein  39.39 
 
 
172 aa  65.1  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242028  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0208  hypothetical protein  23.17 
 
 
735 aa  64.3  0.000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3035  hypothetical protein  52.31 
 
 
70 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.53136  normal  0.751675 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.56 
 
 
266 aa  57  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0659  HesA/MoeB/ThiF type protein  32.47 
 
 
306 aa  56.2  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113753  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.41 
 
 
356 aa  55.1  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.124053  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4482  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.76 
 
 
592 aa  54.3  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4877  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.83 
 
 
343 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.360367  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2477  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.38 
 
 
338 aa  53.9  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.509569 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2874  hypothetical protein  40.3 
 
 
352 aa  52  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6576  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.83 
 
 
348 aa  51.2  0.00007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1985  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.45 
 
 
367 aa  50.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1661  rhodanese-like protein  28.12 
 
 
380 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0134  ThiF family protein  41.1 
 
 
594 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4541  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  25 
 
 
339 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.43862 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1880  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 
282 aa  48.9  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3716  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
354 aa  49.3  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0643  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  27.27 
 
 
339 aa  49.3  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0643  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  27.27 
 
 
339 aa  49.3  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1307  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.97 
 
 
250 aa  48.5  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13890  hypothetical protein  29.13 
 
 
163 aa  48.9  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0446  thiF protein  31.01 
 
 
235 aa  48.1  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0750126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0887  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  28.23 
 
 
339 aa  48.5  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000828015  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1138  thiamine biosynthesis protein ThiF  38.6 
 
 
213 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0733  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  26.45 
 
 
339 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0699  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  26.45 
 
 
339 aa  47.8  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0390  rhodanese-like protein  32.47 
 
 
378 aa  47.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6102  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.21 
 
 
380 aa  47.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202691  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0649  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  26.45 
 
 
339 aa  47.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0810  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  26.45 
 
 
339 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.48292e-47 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1107  adenylyltransferase thiF  26.92 
 
 
260 aa  47  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0151  hypothetical protein  30.07 
 
 
300 aa  47  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1936  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  46.43 
 
 
407 aa  47  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2344  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.73 
 
 
591 aa  46.6  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19350  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  41.38 
 
 
451 aa  46.2  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.0196057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0790  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  24.19 
 
 
339 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3361  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  29.81 
 
 
338 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0803  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  29.91 
 
 
339 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.793608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3275  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  29.81 
 
 
338 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.649383  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3180  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.66 
 
 
249 aa  46.6  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.507931  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17601  molybdopterin biosynthesis protein  24.7 
 
 
381 aa  46.6  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0884  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.35 
 
 
259 aa  46.2  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.370155 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3624  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  29.81 
 
 
338 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.335  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.57 
 
 
355 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2212  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.22 
 
 
576 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0620  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  26.83 
 
 
339 aa  46.6  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0694  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.47 
 
 
212 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.656502 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0941  molybdopterin biosynthesis MoeB protein  27.11 
 
 
368 aa  45.4  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.217219  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.46 
 
 
604 aa  45.8  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0520  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.12 
 
 
386 aa  45.8  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.185889  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1073  ThiF/MoeZ/MoeB domain/rhodanese-like domain-containing protein  27.11 
 
 
368 aa  45.4  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3575  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  29.81 
 
 
338 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3325  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  29.81 
 
 
338 aa  45.8  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2211  hypothetical protein  28.95 
 
 
164 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3675  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  29.81 
 
 
338 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1642  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  29.81 
 
 
338 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17561  molybdopterin biosynthesis protein  24.82 
 
 
382 aa  45.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44749  sumo-activating enzyme 2  34.29 
 
 
643 aa  45.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.97194  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0492  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.01 
 
 
407 aa  45.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601241 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3825  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.66 
 
 
387 aa  45.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.380998  normal  0.141711 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02450  ubiquitin-like activating enzyme (UbaB), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10510)  30.91 
 
 
610 aa  44.7  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.625763 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.25 
 
 
247 aa  44.7  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.9 
 
 
266 aa  44.7  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246319  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.1 
 
 
219 aa  44.7  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00160483  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.09 
 
 
390 aa  44.7  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3592  thiamine/molybdopterin biosynthesis MoeB-like protein  28.85 
 
 
338 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.72 
 
 
278 aa  44.3  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0004  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  25.49 
 
 
253 aa  44.3  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.714167  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0317  hypothetical protein  30.22 
 
 
162 aa  44.3  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  38.6 
 
 
242 aa  43.9  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.59 
 
 
242 aa  43.9  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>