26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0208 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0208  hypothetical protein  100 
 
 		 735 aa  1509    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3185  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.23 
 
 		 725 aa  256  1.0000000000000001e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.384738  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.55 
 
 		 751 aa  251  4e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2740  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.55 
 
 		 751 aa  251  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3040  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  29.55 
 
 		 751 aa  251  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.299146 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2874  hypothetical protein  29.73 
 
 		 352 aa  120  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2873  hypothetical protein  38.84 
 
 		 235 aa  76.6  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2872  hypothetical protein  26.44 
 
 		 223 aa  70.1  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4359  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.17 
 
 		 751 aa  65.1  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.369911  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1262  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.18 
 
 		 769 aa  64.7  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.772554  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0356  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  21.93 
 
 		 771 aa  53.9  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0134  ThiF family protein  36.36 
 
 		 594 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2344  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.36 
 
 		 591 aa  52.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19350  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  29.63 
 
 		 451 aa  49.7  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.274703  normal  0.0196057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2171  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.47 
 
 		 255 aa  48.5  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.500707  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0046  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.54 
 
 		 266 aa  47  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6934  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.07 
 
 		 596 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.97 
 
 		 280 aa  46.6  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2002  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.83 
 
 		 268 aa  45.8  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.46 
 
 		 389 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1855  thiamine biosynthesis protein ThiF  31.31 
 
 		 199 aa  45.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5142  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.25 
 
 		 553 aa  45.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1275  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.08 
 
 		 291 aa  45.1  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4482  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.11 
 
 		 592 aa  44.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0038  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.85 
 
 		 278 aa  44.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.969035  normal  0.260889 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  31.48 
 
 		 257 aa  44.3  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>