23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3040 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3040  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  100 
 
 		 751 aa  1518    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.299146 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  99.87 
 
 		 751 aa  1515    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2740  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  99.87 
 
 		 751 aa  1515    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3185  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.23 
 
 		 725 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.384738  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0208  hypothetical protein  29.11 
 
 		 735 aa  156  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2874  hypothetical protein  34.02 
 
 		 352 aa  138  4e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1262  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.95 
 
 		 769 aa  114  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.772554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2872  hypothetical protein  33.71 
 
 		 223 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2873  hypothetical protein  38.64 
 
 		 235 aa  87  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4359  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.67 
 
 		 751 aa  80.9  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.369911  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0134  ThiF family protein  32.87 
 
 		 594 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2344  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.13 
 
 		 591 aa  50.1  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0356  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.8 
 
 		 771 aa  48.5  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.952881  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.57 
 
 		 580 aa  47.8  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.329813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.24 
 
 		 598 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0599  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.51 
 
 		 354 aa  47.4  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6934  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44 
 
 		 596 aa  46.6  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9116  molybdopterin biosynthesis protein  35.45 
 
 		 293 aa  46.6  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0659  HesA/MoeB/ThiF type protein  35.29 
 
 		 306 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.71 
 
 		 377 aa  46.6  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3926  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.25 
 
 		 364 aa  45.4  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396526  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2571  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.93 
 
 		 243 aa  45.4  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.508745  normal  0.0248599 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1572  thiamine biosynthesis protein ThiF  37.74 
 
 		 199 aa  44.3  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.109403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>