17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2048 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2048  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  353  6.999999999999999e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.242028  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0356  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.35 
 
 		 771 aa  83.6  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.952881  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4359  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.39 
 
 		 751 aa  65.1  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.369911  normal  0.849345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2211  hypothetical protein  28.12 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1317  hypothetical protein  29.69 
 
 		 159 aa  55.1  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711749  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0659  HesA/MoeB/ThiF type protein  29.69 
 
 		 306 aa  52.4  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4483  hypothetical protein  29.92 
 
 		 168 aa  52  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13890  hypothetical protein  26.15 
 
 		 163 aa  50.8  0.000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0317  hypothetical protein  28.71 
 
 		 162 aa  48.1  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.565944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1262  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.04 
 
 		 769 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.772554  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2874  hypothetical protein  32.73 
 
 		 352 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2343  hypothetical protein  27.78 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3185  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.96 
 
 		 725 aa  41.6  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.384738  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3040  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  41.18 
 
 		 751 aa  41.6  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.299146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2740  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.18 
 
 		 751 aa  41.6  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.493167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2606  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.18 
 
 		 751 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.500169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1371  hypothetical protein  30.19 
 
 		 153 aa  41.2  0.007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0211434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>