21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4420 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4420  surface presentation of antigens (SPOA) protein  100 
 
 		 321 aa  668    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.401557 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0628  lateral flagellar export/assembly protein  30.6 
 
 		 292 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0708  flagellar motor switch protein  30.56 
 
 		 299 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0314955  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0247  lateral flagellar export/assembly protein LfiM  32.12 
 
 		 283 aa  102  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3385  surface presentation of antigens (SPOA) protein  32.48 
 
 		 283 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4650  surface presentation of antigens (SPOA) protein  26.67 
 
 		 290 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.496098  normal  0.506962 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001182  putative flagellar motor switch protein  25.74 
 
 		 272 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0218  hypothetical protein  24.33 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04969  flagellar motor switch protein  32.99 
 
 		 272 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1714  flagellar motor switch protein FliN  34.15 
 
 		 130 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.161406  normal  0.04146 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0639  flagellar motor switch protein FliN  33.72 
 
 		 108 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.26439  normal  0.185523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0618  flagellar motor switch protein FliN  33.72 
 
 		 108 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.662589 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0650  flagellar motor switch protein FliN  33.72 
 
 		 108 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.128908 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3215  flagellar motor switch protein FliN  30.49 
 
 		 125 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3662  hypothetical protein  24.08 
 
 		 293 aa  46.6  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0169  hypothetical protein  34.21 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1458  flagellar motor switch protein FliM  24.28 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2806  flagellar motor switch protein FliN  31.65 
 
 		 109 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.884616 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0020  flagellar motor switch protein FliN  32.04 
 
 		 110 aa  45.4  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0081  hypothetical protein  34.43 
 
 		 288 aa  44.3  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1091  surface presentation of antigens (SPOA) protein  32.26 
 
 		 131 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.553841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>